Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y259

CHKB, Choline/ethanolamine kinase, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHKBQ9Y259 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CHKBQ9Y259 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CHKBQ9Y259 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CHKBQ9Y259 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CHKBQ9Y259 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CHKBQ9Y259 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CHKBQ9Y259 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
CHKBQ9Y259 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CHKBQ9Y259 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CHKBQ9Y259 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CHKBQ9Y259 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CHKBQ9Y259 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CHKBQ9Y259 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CHKBQ9Y259 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CHKBQ9Y259 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CHKBQ9Y259 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CHKBQ9Y259 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CHKBQ9Y259 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CHKBQ9Y259 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CHKBQ9Y259 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CHKBQ9Y259 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CHKBQ9Y259 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CHKBQ9Y259 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CHKBQ9Y259 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CHKBQ9Y259 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CHKBQ9Y259 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CHKBQ9Y259 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CHKBQ9Y259 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CHKBQ9Y259 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CHKBQ9Y259 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CHKBQ9Y259 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CHKBQ9Y259 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CHKBQ9Y259 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CHKBQ9Y259 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CHKBQ9Y259 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CHKBQ9Y259 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CHKBQ9Y259 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CHKBQ9Y259 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CHKBQ9Y259 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CHKBQ9Y259 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CHKBQ9Y259 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CHKBQ9Y259 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CHKBQ9Y259 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CHKBQ9Y259 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CHKBQ9Y259 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CHKBQ9Y259 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CHKBQ9Y259 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CHKBQ9Y259 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CHKBQ9Y259 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
CHKBQ9Y259 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CHKBQ9Y259 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CHKBQ9Y259 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CHKBQ9Y259 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CHKBQ9Y259 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CHKBQ9Y259 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CHKBQ9Y259 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CHKBQ9Y259 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CHKBQ9Y259 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CHKBQ9Y259 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
CHKBQ9Y259 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CHKBQ9Y259 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CHKBQ9Y259 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CHKBQ9Y259 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CHKBQ9Y259 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CHKBQ9Y259 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CHKBQ9Y259 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CHKBQ9Y259 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CHKBQ9Y259 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CHKBQ9Y259 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
CHKBQ9Y259 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CHKBQ9Y259 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CHKBQ9Y259 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CHKBQ9Y259 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CHKBQ9Y259 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CHKBQ9Y259 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
CHKBQ9Y259 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CHKBQ9Y259 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CHKBQ9Y259 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CHKBQ9Y259 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CHKBQ9Y259 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
CHKBQ9Y259 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CHKBQ9Y259 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CHKBQ9Y259 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CHKBQ9Y259 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CHKBQ9Y259 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CHKBQ9Y259 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CHKBQ9Y259 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CHKBQ9Y259 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CHKBQ9Y259 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CHKBQ9Y259 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CHKBQ9Y259 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CHKBQ9Y259 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
CHKBQ9Y259 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CHKBQ9Y259 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CHKBQ9Y259 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CHKBQ9Y259 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
CHKBQ9Y259 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CHKBQ9Y259 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CHKBQ9Y259 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CHKBQ9Y259 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.8 ms