Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQF0

ERVW-1, Syncytin-1, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVW-1Q9UQF0 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ERVW-1Q9UQF0 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ERVW-1Q9UQF0 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ERVW-1Q9UQF0 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ERVW-1Q9UQF0 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ERVW-1Q9UQF0 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ERVW-1Q9UQF0 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ERVW-1Q9UQF0 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ERVW-1Q9UQF0 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ERVW-1Q9UQF0 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ERVW-1Q9UQF0 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ERVW-1Q9UQF0 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ERVW-1Q9UQF0 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ERVW-1Q9UQF0 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ERVW-1Q9UQF0 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ERVW-1Q9UQF0 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ERVW-1Q9UQF0 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ERVW-1Q9UQF0 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ERVW-1Q9UQF0 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ERVW-1Q9UQF0 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ERVW-1Q9UQF0 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ERVW-1Q9UQF0 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ERVW-1Q9UQF0 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ERVW-1Q9UQF0 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ERVW-1Q9UQF0 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ERVW-1Q9UQF0 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ERVW-1Q9UQF0 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ERVW-1Q9UQF0 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ERVW-1Q9UQF0 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ERVW-1Q9UQF0 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ERVW-1Q9UQF0 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ERVW-1Q9UQF0 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ERVW-1Q9UQF0 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
ERVW-1Q9UQF0 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
ERVW-1Q9UQF0 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
ERVW-1Q9UQF0 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
ERVW-1Q9UQF0 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
ERVW-1Q9UQF0 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
ERVW-1Q9UQF0 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
ERVW-1Q9UQF0 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
ERVW-1Q9UQF0 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
ERVW-1Q9UQF0 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
ERVW-1Q9UQF0 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
ERVW-1Q9UQF0 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
ERVW-1Q9UQF0 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
ERVW-1Q9UQF0 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
ERVW-1Q9UQF0 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
ERVW-1Q9UQF0 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
ERVW-1Q9UQF0 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
ERVW-1Q9UQF0 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
ERVW-1Q9UQF0 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
ERVW-1Q9UQF0 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
ERVW-1Q9UQF0 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
ERVW-1Q9UQF0 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
ERVW-1Q9UQF0 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
ERVW-1Q9UQF0 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
ERVW-1Q9UQF0 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
ERVW-1Q9UQF0 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
ERVW-1Q9UQF0 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
ERVW-1Q9UQF0 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
ERVW-1Q9UQF0 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
ERVW-1Q9UQF0 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
ERVW-1Q9UQF0 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
ERVW-1Q9UQF0 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
ERVW-1Q9UQF0 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
ERVW-1Q9UQF0 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
ERVW-1Q9UQF0 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
ERVW-1Q9UQF0 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
ERVW-1Q9UQF0 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ERVW-1Q9UQF0 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ERVW-1Q9UQF0 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ERVW-1Q9UQF0 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
ERVW-1Q9UQF0 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
ERVW-1Q9UQF0 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ERVW-1Q9UQF0 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
ERVW-1Q9UQF0 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
ERVW-1Q9UQF0 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
ERVW-1Q9UQF0 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
ERVW-1Q9UQF0 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
ERVW-1Q9UQF0 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
ERVW-1Q9UQF0 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
ERVW-1Q9UQF0 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
ERVW-1Q9UQF0 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
ERVW-1Q9UQF0 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
ERVW-1Q9UQF0 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ERVW-1Q9UQF0 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
ERVW-1Q9UQF0 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ERVW-1Q9UQF0 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ERVW-1Q9UQF0 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
ERVW-1Q9UQF0 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
ERVW-1Q9UQF0 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ERVW-1Q9UQF0 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ERVW-1Q9UQF0 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ERVW-1Q9UQF0 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
ERVW-1Q9UQF0 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ERVW-1Q9UQF0 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ERVW-1Q9UQF0 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ERVW-1Q9UQF0 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ERVW-1Q9UQF0 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ERVW-1Q9UQF0 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms