Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULU4

ZMYND8, Protein kinase C-binding protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,186 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZMYND8Q9ULU4 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
ZMYND8Q9ULU4 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
ZMYND8Q9ULU4 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
ZMYND8Q9ULU4 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
ZMYND8Q9ULU4 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
ZMYND8Q9ULU4 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
ZMYND8Q9ULU4 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
ZMYND8Q9ULU4 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
ZMYND8Q9ULU4 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
ZMYND8Q9ULU4 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
ZMYND8Q9ULU4 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
ZMYND8Q9ULU4 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
ZMYND8Q9ULU4 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
ZMYND8Q9ULU4 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
ZMYND8Q9ULU4 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
ZMYND8Q9ULU4 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
ZMYND8Q9ULU4 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
ZMYND8Q9ULU4 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
ZMYND8Q9ULU4 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
ZMYND8Q9ULU4 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
ZMYND8Q9ULU4 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
ZMYND8Q9ULU4 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
ZMYND8Q9ULU4 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
ZMYND8Q9ULU4 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
ZMYND8Q9ULU4 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
ZMYND8Q9ULU4 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
ZMYND8Q9ULU4 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
ZMYND8Q9ULU4 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ZMYND8Q9ULU4 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
ZMYND8Q9ULU4 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ZMYND8Q9ULU4 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
ZMYND8Q9ULU4 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
ZMYND8Q9ULU4 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
ZMYND8Q9ULU4 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ZMYND8Q9ULU4 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ZMYND8Q9ULU4 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
ZMYND8Q9ULU4 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ZMYND8Q9ULU4 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
ZMYND8Q9ULU4 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
ZMYND8Q9ULU4 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ZMYND8Q9ULU4 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
ZMYND8Q9ULU4 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
ZMYND8Q9ULU4 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
ZMYND8Q9ULU4 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ZMYND8Q9ULU4 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ZMYND8Q9ULU4 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ZMYND8Q9ULU4 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ZMYND8Q9ULU4 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ZMYND8Q9ULU4 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
ZMYND8Q9ULU4 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
ZMYND8Q9ULU4 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
ZMYND8Q9ULU4 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
ZMYND8Q9ULU4 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
ZMYND8Q9ULU4 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
ZMYND8Q9ULU4 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC20.64■□□□□ 0.89
ZMYND8Q9ULU4 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
ZMYND8Q9ULU4 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
ZMYND8Q9ULU4 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ZMYND8Q9ULU4 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
ZMYND8Q9ULU4 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
ZMYND8Q9ULU4 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
ZMYND8Q9ULU4 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ZMYND8Q9ULU4 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ZMYND8Q9ULU4 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ZMYND8Q9ULU4 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ZMYND8Q9ULU4 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ZMYND8Q9ULU4 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ZMYND8Q9ULU4 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ZMYND8Q9ULU4 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ZMYND8Q9ULU4 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ZMYND8Q9ULU4 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ZMYND8Q9ULU4 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ZMYND8Q9ULU4 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ZMYND8Q9ULU4 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ZMYND8Q9ULU4 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ZMYND8Q9ULU4 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ZMYND8Q9ULU4 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ZMYND8Q9ULU4 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ZMYND8Q9ULU4 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
ZMYND8Q9ULU4 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ZMYND8Q9ULU4 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ZMYND8Q9ULU4 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ZMYND8Q9ULU4 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ZMYND8Q9ULU4 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
ZMYND8Q9ULU4 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ZMYND8Q9ULU4 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ZMYND8Q9ULU4 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ZMYND8Q9ULU4 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ZMYND8Q9ULU4 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ZMYND8Q9ULU4 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ZMYND8Q9ULU4 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ZMYND8Q9ULU4 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ZMYND8Q9ULU4 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ZMYND8Q9ULU4 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ZMYND8Q9ULU4 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ZMYND8Q9ULU4 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ZMYND8Q9ULU4 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ZMYND8Q9ULU4 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ZMYND8Q9ULU4 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ZMYND8Q9ULU4 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms