Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKT5

FBXO4, F-box only protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO4Q9UKT5 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
FBXO4Q9UKT5 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
FBXO4Q9UKT5 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
FBXO4Q9UKT5 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
FBXO4Q9UKT5 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
FBXO4Q9UKT5 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
FBXO4Q9UKT5 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
FBXO4Q9UKT5 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
FBXO4Q9UKT5 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
FBXO4Q9UKT5 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
FBXO4Q9UKT5 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
FBXO4Q9UKT5 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
FBXO4Q9UKT5 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
FBXO4Q9UKT5 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
FBXO4Q9UKT5 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
FBXO4Q9UKT5 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
FBXO4Q9UKT5 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
FBXO4Q9UKT5 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
FBXO4Q9UKT5 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
FBXO4Q9UKT5 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
FBXO4Q9UKT5 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
FBXO4Q9UKT5 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
FBXO4Q9UKT5 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
FBXO4Q9UKT5 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
FBXO4Q9UKT5 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
FBXO4Q9UKT5 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
FBXO4Q9UKT5 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
FBXO4Q9UKT5 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
FBXO4Q9UKT5 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
FBXO4Q9UKT5 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
FBXO4Q9UKT5 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
FBXO4Q9UKT5 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
FBXO4Q9UKT5 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
FBXO4Q9UKT5 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
FBXO4Q9UKT5 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
FBXO4Q9UKT5 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
FBXO4Q9UKT5 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
FBXO4Q9UKT5 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
FBXO4Q9UKT5 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
FBXO4Q9UKT5 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
FBXO4Q9UKT5 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
FBXO4Q9UKT5 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
FBXO4Q9UKT5 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.54
FBXO4Q9UKT5 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
FBXO4Q9UKT5 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FBXO4Q9UKT5 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FBXO4Q9UKT5 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FBXO4Q9UKT5 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FBXO4Q9UKT5 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FBXO4Q9UKT5 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FBXO4Q9UKT5 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FBXO4Q9UKT5 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FBXO4Q9UKT5 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
FBXO4Q9UKT5 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
FBXO4Q9UKT5 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
FBXO4Q9UKT5 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
FBXO4Q9UKT5 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
FBXO4Q9UKT5 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
FBXO4Q9UKT5 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FBXO4Q9UKT5 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FBXO4Q9UKT5 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FBXO4Q9UKT5 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
FBXO4Q9UKT5 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FBXO4Q9UKT5 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FBXO4Q9UKT5 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
FBXO4Q9UKT5 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FBXO4Q9UKT5 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
FBXO4Q9UKT5 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FBXO4Q9UKT5 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
FBXO4Q9UKT5 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FBXO4Q9UKT5 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
FBXO4Q9UKT5 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
FBXO4Q9UKT5 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
FBXO4Q9UKT5 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
FBXO4Q9UKT5 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FBXO4Q9UKT5 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
FBXO4Q9UKT5 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
FBXO4Q9UKT5 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
FBXO4Q9UKT5 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
FBXO4Q9UKT5 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FBXO4Q9UKT5 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FBXO4Q9UKT5 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FBXO4Q9UKT5 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FBXO4Q9UKT5 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FBXO4Q9UKT5 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
FBXO4Q9UKT5 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FBXO4Q9UKT5 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
FBXO4Q9UKT5 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FBXO4Q9UKT5 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FBXO4Q9UKT5 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
FBXO4Q9UKT5 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FBXO4Q9UKT5 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
FBXO4Q9UKT5 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FBXO4Q9UKT5 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
FBXO4Q9UKT5 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
FBXO4Q9UKT5 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FBXO4Q9UKT5 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FBXO4Q9UKT5 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FBXO4Q9UKT5 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FBXO4Q9UKT5 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms