Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJD0

RIMS3, Regulating synaptic membrane exocytosis protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIMS3Q9UJD0 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RIMS3Q9UJD0 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RIMS3Q9UJD0 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RIMS3Q9UJD0 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RIMS3Q9UJD0 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RIMS3Q9UJD0 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RIMS3Q9UJD0 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RIMS3Q9UJD0 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RIMS3Q9UJD0 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RIMS3Q9UJD0 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RIMS3Q9UJD0 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RIMS3Q9UJD0 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RIMS3Q9UJD0 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RIMS3Q9UJD0 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RIMS3Q9UJD0 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RIMS3Q9UJD0 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RIMS3Q9UJD0 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
RIMS3Q9UJD0 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RIMS3Q9UJD0 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RIMS3Q9UJD0 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RIMS3Q9UJD0 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RIMS3Q9UJD0 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RIMS3Q9UJD0 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RIMS3Q9UJD0 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RIMS3Q9UJD0 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RIMS3Q9UJD0 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RIMS3Q9UJD0 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RIMS3Q9UJD0 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RIMS3Q9UJD0 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RIMS3Q9UJD0 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RIMS3Q9UJD0 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RIMS3Q9UJD0 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RIMS3Q9UJD0 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RIMS3Q9UJD0 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RIMS3Q9UJD0 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RIMS3Q9UJD0 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RIMS3Q9UJD0 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RIMS3Q9UJD0 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RIMS3Q9UJD0 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
RIMS3Q9UJD0 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RIMS3Q9UJD0 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RIMS3Q9UJD0 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RIMS3Q9UJD0 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RIMS3Q9UJD0 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RIMS3Q9UJD0 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RIMS3Q9UJD0 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RIMS3Q9UJD0 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RIMS3Q9UJD0 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RIMS3Q9UJD0 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RIMS3Q9UJD0 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RIMS3Q9UJD0 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RIMS3Q9UJD0 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
RIMS3Q9UJD0 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RIMS3Q9UJD0 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
RIMS3Q9UJD0 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RIMS3Q9UJD0 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RIMS3Q9UJD0 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RIMS3Q9UJD0 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RIMS3Q9UJD0 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RIMS3Q9UJD0 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RIMS3Q9UJD0 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RIMS3Q9UJD0 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RIMS3Q9UJD0 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RIMS3Q9UJD0 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
RIMS3Q9UJD0 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
RIMS3Q9UJD0 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
RIMS3Q9UJD0 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
RIMS3Q9UJD0 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
RIMS3Q9UJD0 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
RIMS3Q9UJD0 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
RIMS3Q9UJD0 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
RIMS3Q9UJD0 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
RIMS3Q9UJD0 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
RIMS3Q9UJD0 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
RIMS3Q9UJD0 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
RIMS3Q9UJD0 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
RIMS3Q9UJD0 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
RIMS3Q9UJD0 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
RIMS3Q9UJD0 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RIMS3Q9UJD0 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RIMS3Q9UJD0 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RIMS3Q9UJD0 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RIMS3Q9UJD0 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RIMS3Q9UJD0 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RIMS3Q9UJD0 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RIMS3Q9UJD0 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RIMS3Q9UJD0 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RIMS3Q9UJD0 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RIMS3Q9UJD0 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RIMS3Q9UJD0 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RIMS3Q9UJD0 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RIMS3Q9UJD0 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RIMS3Q9UJD0 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RIMS3Q9UJD0 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RIMS3Q9UJD0 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RIMS3Q9UJD0 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RIMS3Q9UJD0 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RIMS3Q9UJD0 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RIMS3Q9UJD0 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RIMS3Q9UJD0 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55 ms