Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHW5

GPN3, GPN-loop GTPase 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPN3Q9UHW5 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GPN3Q9UHW5 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GPN3Q9UHW5 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GPN3Q9UHW5 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GPN3Q9UHW5 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
GPN3Q9UHW5 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GPN3Q9UHW5 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GPN3Q9UHW5 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GPN3Q9UHW5 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GPN3Q9UHW5 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GPN3Q9UHW5 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GPN3Q9UHW5 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
GPN3Q9UHW5 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GPN3Q9UHW5 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GPN3Q9UHW5 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GPN3Q9UHW5 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GPN3Q9UHW5 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GPN3Q9UHW5 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
GPN3Q9UHW5 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GPN3Q9UHW5 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GPN3Q9UHW5 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GPN3Q9UHW5 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GPN3Q9UHW5 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
GPN3Q9UHW5 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
GPN3Q9UHW5 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
GPN3Q9UHW5 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
GPN3Q9UHW5 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GPN3Q9UHW5 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GPN3Q9UHW5 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GPN3Q9UHW5 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GPN3Q9UHW5 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GPN3Q9UHW5 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GPN3Q9UHW5 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GPN3Q9UHW5 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
GPN3Q9UHW5 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GPN3Q9UHW5 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GPN3Q9UHW5 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GPN3Q9UHW5 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GPN3Q9UHW5 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GPN3Q9UHW5 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
GPN3Q9UHW5 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GPN3Q9UHW5 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GPN3Q9UHW5 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GPN3Q9UHW5 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GPN3Q9UHW5 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GPN3Q9UHW5 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GPN3Q9UHW5 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GPN3Q9UHW5 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GPN3Q9UHW5 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GPN3Q9UHW5 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GPN3Q9UHW5 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GPN3Q9UHW5 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
GPN3Q9UHW5 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GPN3Q9UHW5 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GPN3Q9UHW5 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GPN3Q9UHW5 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GPN3Q9UHW5 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GPN3Q9UHW5 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GPN3Q9UHW5 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GPN3Q9UHW5 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GPN3Q9UHW5 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GPN3Q9UHW5 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GPN3Q9UHW5 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GPN3Q9UHW5 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GPN3Q9UHW5 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
GPN3Q9UHW5 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GPN3Q9UHW5 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
GPN3Q9UHW5 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GPN3Q9UHW5 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GPN3Q9UHW5 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GPN3Q9UHW5 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GPN3Q9UHW5 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GPN3Q9UHW5 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GPN3Q9UHW5 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GPN3Q9UHW5 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
GPN3Q9UHW5 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GPN3Q9UHW5 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GPN3Q9UHW5 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GPN3Q9UHW5 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GPN3Q9UHW5 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GPN3Q9UHW5 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GPN3Q9UHW5 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GPN3Q9UHW5 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GPN3Q9UHW5 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GPN3Q9UHW5 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GPN3Q9UHW5 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GPN3Q9UHW5 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GPN3Q9UHW5 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GPN3Q9UHW5 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GPN3Q9UHW5 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GPN3Q9UHW5 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GPN3Q9UHW5 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GPN3Q9UHW5 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GPN3Q9UHW5 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GPN3Q9UHW5 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GPN3Q9UHW5 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GPN3Q9UHW5 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GPN3Q9UHW5 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GPN3Q9UHW5 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GPN3Q9UHW5 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms