Protein–RNA interactions for Protein: Q9UEE9

CFDP1, Craniofacial development protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFDP1Q9UEE9 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CFDP1Q9UEE9 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CFDP1Q9UEE9 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CFDP1Q9UEE9 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CFDP1Q9UEE9 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CFDP1Q9UEE9 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CFDP1Q9UEE9 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CFDP1Q9UEE9 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CFDP1Q9UEE9 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CFDP1Q9UEE9 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
CFDP1Q9UEE9 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CFDP1Q9UEE9 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CFDP1Q9UEE9 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
CFDP1Q9UEE9 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CFDP1Q9UEE9 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CFDP1Q9UEE9 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
CFDP1Q9UEE9 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CFDP1Q9UEE9 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CFDP1Q9UEE9 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
CFDP1Q9UEE9 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CFDP1Q9UEE9 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CFDP1Q9UEE9 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CFDP1Q9UEE9 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CFDP1Q9UEE9 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CFDP1Q9UEE9 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CFDP1Q9UEE9 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CFDP1Q9UEE9 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CFDP1Q9UEE9 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CFDP1Q9UEE9 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CFDP1Q9UEE9 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CFDP1Q9UEE9 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
CFDP1Q9UEE9 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CFDP1Q9UEE9 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CFDP1Q9UEE9 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
CFDP1Q9UEE9 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CFDP1Q9UEE9 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CFDP1Q9UEE9 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CFDP1Q9UEE9 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CFDP1Q9UEE9 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CFDP1Q9UEE9 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CFDP1Q9UEE9 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CFDP1Q9UEE9 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CFDP1Q9UEE9 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CFDP1Q9UEE9 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CFDP1Q9UEE9 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CFDP1Q9UEE9 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CFDP1Q9UEE9 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CFDP1Q9UEE9 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CFDP1Q9UEE9 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CFDP1Q9UEE9 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CFDP1Q9UEE9 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CFDP1Q9UEE9 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CFDP1Q9UEE9 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CFDP1Q9UEE9 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CFDP1Q9UEE9 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CFDP1Q9UEE9 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CFDP1Q9UEE9 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CFDP1Q9UEE9 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CFDP1Q9UEE9 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CFDP1Q9UEE9 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CFDP1Q9UEE9 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CFDP1Q9UEE9 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CFDP1Q9UEE9 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
CFDP1Q9UEE9 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CFDP1Q9UEE9 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CFDP1Q9UEE9 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CFDP1Q9UEE9 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CFDP1Q9UEE9 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CFDP1Q9UEE9 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CFDP1Q9UEE9 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CFDP1Q9UEE9 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CFDP1Q9UEE9 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CFDP1Q9UEE9 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CFDP1Q9UEE9 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CFDP1Q9UEE9 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CFDP1Q9UEE9 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CFDP1Q9UEE9 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CFDP1Q9UEE9 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CFDP1Q9UEE9 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CFDP1Q9UEE9 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CFDP1Q9UEE9 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
CFDP1Q9UEE9 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CFDP1Q9UEE9 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CFDP1Q9UEE9 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CFDP1Q9UEE9 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CFDP1Q9UEE9 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CFDP1Q9UEE9 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CFDP1Q9UEE9 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CFDP1Q9UEE9 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CFDP1Q9UEE9 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CFDP1Q9UEE9 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CFDP1Q9UEE9 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CFDP1Q9UEE9 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CFDP1Q9UEE9 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
CFDP1Q9UEE9 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CFDP1Q9UEE9 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CFDP1Q9UEE9 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CFDP1Q9UEE9 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CFDP1Q9UEE9 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CFDP1Q9UEE9 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms