Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBW8

COPS7A, COP9 signalosome complex subunit 7a, humanhuman

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Length 275 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS7AQ9UBW8 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
COPS7AQ9UBW8 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
COPS7AQ9UBW8 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
COPS7AQ9UBW8 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
COPS7AQ9UBW8 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
COPS7AQ9UBW8 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
COPS7AQ9UBW8 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
COPS7AQ9UBW8 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
COPS7AQ9UBW8 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
COPS7AQ9UBW8 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
COPS7AQ9UBW8 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
COPS7AQ9UBW8 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
COPS7AQ9UBW8 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
COPS7AQ9UBW8 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
COPS7AQ9UBW8 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
COPS7AQ9UBW8 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
COPS7AQ9UBW8 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
COPS7AQ9UBW8 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
COPS7AQ9UBW8 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
COPS7AQ9UBW8 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
COPS7AQ9UBW8 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
COPS7AQ9UBW8 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
COPS7AQ9UBW8 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
COPS7AQ9UBW8 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
COPS7AQ9UBW8 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
COPS7AQ9UBW8 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
COPS7AQ9UBW8 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
COPS7AQ9UBW8 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
COPS7AQ9UBW8 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
COPS7AQ9UBW8 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
COPS7AQ9UBW8 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
COPS7AQ9UBW8 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
COPS7AQ9UBW8 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
COPS7AQ9UBW8 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
COPS7AQ9UBW8 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
COPS7AQ9UBW8 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
COPS7AQ9UBW8 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
COPS7AQ9UBW8 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
COPS7AQ9UBW8 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
COPS7AQ9UBW8 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
COPS7AQ9UBW8 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
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COPS7AQ9UBW8 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
COPS7AQ9UBW8 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
COPS7AQ9UBW8 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
COPS7AQ9UBW8 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
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COPS7AQ9UBW8 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
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COPS7AQ9UBW8 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
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COPS7AQ9UBW8 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
COPS7AQ9UBW8 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
COPS7AQ9UBW8 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
COPS7AQ9UBW8 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
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COPS7AQ9UBW8 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
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COPS7AQ9UBW8 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
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COPS7AQ9UBW8 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
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COPS7AQ9UBW8 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
COPS7AQ9UBW8 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
COPS7AQ9UBW8 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
COPS7AQ9UBW8 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
COPS7AQ9UBW8 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
COPS7AQ9UBW8 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
COPS7AQ9UBW8 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
COPS7AQ9UBW8 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
COPS7AQ9UBW8 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
COPS7AQ9UBW8 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
COPS7AQ9UBW8 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
COPS7AQ9UBW8 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
COPS7AQ9UBW8 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
COPS7AQ9UBW8 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
COPS7AQ9UBW8 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
COPS7AQ9UBW8 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
COPS7AQ9UBW8 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
COPS7AQ9UBW8 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
COPS7AQ9UBW8 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
COPS7AQ9UBW8 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
COPS7AQ9UBW8 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
COPS7AQ9UBW8 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
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