Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBP4

DKK3, Dickkopf-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK3Q9UBP4 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
DKK3Q9UBP4 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.58
DKK3Q9UBP4 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
DKK3Q9UBP4 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
DKK3Q9UBP4 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
DKK3Q9UBP4 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
DKK3Q9UBP4 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
DKK3Q9UBP4 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
DKK3Q9UBP4 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
DKK3Q9UBP4 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
DKK3Q9UBP4 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
DKK3Q9UBP4 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
DKK3Q9UBP4 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
DKK3Q9UBP4 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
DKK3Q9UBP4 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
DKK3Q9UBP4 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
DKK3Q9UBP4 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
DKK3Q9UBP4 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
DKK3Q9UBP4 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
DKK3Q9UBP4 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
DKK3Q9UBP4 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
DKK3Q9UBP4 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
DKK3Q9UBP4 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
DKK3Q9UBP4 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
DKK3Q9UBP4 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
DKK3Q9UBP4 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
DKK3Q9UBP4 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
DKK3Q9UBP4 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
DKK3Q9UBP4 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
DKK3Q9UBP4 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
DKK3Q9UBP4 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
DKK3Q9UBP4 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
DKK3Q9UBP4 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
DKK3Q9UBP4 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
DKK3Q9UBP4 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
DKK3Q9UBP4 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
DKK3Q9UBP4 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
DKK3Q9UBP4 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
DKK3Q9UBP4 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
DKK3Q9UBP4 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
DKK3Q9UBP4 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
DKK3Q9UBP4 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
DKK3Q9UBP4 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
DKK3Q9UBP4 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
DKK3Q9UBP4 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
DKK3Q9UBP4 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
DKK3Q9UBP4 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
DKK3Q9UBP4 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
DKK3Q9UBP4 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
DKK3Q9UBP4 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
DKK3Q9UBP4 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
DKK3Q9UBP4 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
DKK3Q9UBP4 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
DKK3Q9UBP4 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
DKK3Q9UBP4 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
DKK3Q9UBP4 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
DKK3Q9UBP4 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
DKK3Q9UBP4 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
DKK3Q9UBP4 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
DKK3Q9UBP4 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
DKK3Q9UBP4 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
DKK3Q9UBP4 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
DKK3Q9UBP4 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
DKK3Q9UBP4 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
DKK3Q9UBP4 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
DKK3Q9UBP4 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
DKK3Q9UBP4 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
DKK3Q9UBP4 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
DKK3Q9UBP4 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
DKK3Q9UBP4 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
DKK3Q9UBP4 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
DKK3Q9UBP4 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
DKK3Q9UBP4 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
DKK3Q9UBP4 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
DKK3Q9UBP4 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
DKK3Q9UBP4 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
DKK3Q9UBP4 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
DKK3Q9UBP4 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
DKK3Q9UBP4 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
DKK3Q9UBP4 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
DKK3Q9UBP4 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
DKK3Q9UBP4 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
DKK3Q9UBP4 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
DKK3Q9UBP4 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
DKK3Q9UBP4 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
DKK3Q9UBP4 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
DKK3Q9UBP4 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
DKK3Q9UBP4 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
DKK3Q9UBP4 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
DKK3Q9UBP4 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
DKK3Q9UBP4 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
DKK3Q9UBP4 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
DKK3Q9UBP4 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
DKK3Q9UBP4 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
DKK3Q9UBP4 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
DKK3Q9UBP4 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
DKK3Q9UBP4 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
DKK3Q9UBP4 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
DKK3Q9UBP4 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
DKK3Q9UBP4 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms