Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBB5

MBD2, Methyl-CpG-binding domain protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD2Q9UBB5 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MBD2Q9UBB5 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MBD2Q9UBB5 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MBD2Q9UBB5 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MBD2Q9UBB5 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MBD2Q9UBB5 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MBD2Q9UBB5 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MBD2Q9UBB5 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MBD2Q9UBB5 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MBD2Q9UBB5 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MBD2Q9UBB5 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MBD2Q9UBB5 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MBD2Q9UBB5 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MBD2Q9UBB5 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MBD2Q9UBB5 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MBD2Q9UBB5 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MBD2Q9UBB5 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MBD2Q9UBB5 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MBD2Q9UBB5 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MBD2Q9UBB5 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
MBD2Q9UBB5 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MBD2Q9UBB5 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MBD2Q9UBB5 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MBD2Q9UBB5 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MBD2Q9UBB5 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
MBD2Q9UBB5 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MBD2Q9UBB5 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MBD2Q9UBB5 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MBD2Q9UBB5 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MBD2Q9UBB5 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MBD2Q9UBB5 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MBD2Q9UBB5 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MBD2Q9UBB5 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MBD2Q9UBB5 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MBD2Q9UBB5 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MBD2Q9UBB5 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
MBD2Q9UBB5 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MBD2Q9UBB5 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MBD2Q9UBB5 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MBD2Q9UBB5 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MBD2Q9UBB5 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MBD2Q9UBB5 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MBD2Q9UBB5 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MBD2Q9UBB5 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MBD2Q9UBB5 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MBD2Q9UBB5 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MBD2Q9UBB5 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MBD2Q9UBB5 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MBD2Q9UBB5 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MBD2Q9UBB5 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MBD2Q9UBB5 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MBD2Q9UBB5 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MBD2Q9UBB5 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MBD2Q9UBB5 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MBD2Q9UBB5 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MBD2Q9UBB5 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MBD2Q9UBB5 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
MBD2Q9UBB5 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MBD2Q9UBB5 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MBD2Q9UBB5 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MBD2Q9UBB5 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MBD2Q9UBB5 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MBD2Q9UBB5 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MBD2Q9UBB5 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MBD2Q9UBB5 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MBD2Q9UBB5 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MBD2Q9UBB5 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MBD2Q9UBB5 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
MBD2Q9UBB5 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MBD2Q9UBB5 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MBD2Q9UBB5 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MBD2Q9UBB5 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MBD2Q9UBB5 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MBD2Q9UBB5 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MBD2Q9UBB5 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MBD2Q9UBB5 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MBD2Q9UBB5 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MBD2Q9UBB5 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MBD2Q9UBB5 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MBD2Q9UBB5 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MBD2Q9UBB5 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MBD2Q9UBB5 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MBD2Q9UBB5 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MBD2Q9UBB5 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MBD2Q9UBB5 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MBD2Q9UBB5 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MBD2Q9UBB5 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MBD2Q9UBB5 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MBD2Q9UBB5 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MBD2Q9UBB5 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MBD2Q9UBB5 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MBD2Q9UBB5 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MBD2Q9UBB5 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MBD2Q9UBB5 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MBD2Q9UBB5 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MBD2Q9UBB5 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MBD2Q9UBB5 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MBD2Q9UBB5 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MBD2Q9UBB5 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MBD2Q9UBB5 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms