Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2H5

USP35, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 35, humanhuman

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Length 1,018 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP35Q9P2H5 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
USP35Q9P2H5 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
USP35Q9P2H5 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
USP35Q9P2H5 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
USP35Q9P2H5 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
USP35Q9P2H5 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
USP35Q9P2H5 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
USP35Q9P2H5 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
USP35Q9P2H5 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
USP35Q9P2H5 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
USP35Q9P2H5 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
USP35Q9P2H5 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
USP35Q9P2H5 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
USP35Q9P2H5 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
USP35Q9P2H5 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
USP35Q9P2H5 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
USP35Q9P2H5 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
USP35Q9P2H5 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
USP35Q9P2H5 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
USP35Q9P2H5 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
USP35Q9P2H5 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
USP35Q9P2H5 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
USP35Q9P2H5 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
USP35Q9P2H5 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
USP35Q9P2H5 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
USP35Q9P2H5 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
USP35Q9P2H5 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
USP35Q9P2H5 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
USP35Q9P2H5 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
USP35Q9P2H5 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
USP35Q9P2H5 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
USP35Q9P2H5 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
USP35Q9P2H5 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
USP35Q9P2H5 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
USP35Q9P2H5 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC25.02■■□□□ 1.6
USP35Q9P2H5 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
USP35Q9P2H5 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC25.02■■□□□ 1.6
USP35Q9P2H5 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
USP35Q9P2H5 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
USP35Q9P2H5 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
USP35Q9P2H5 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
USP35Q9P2H5 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
USP35Q9P2H5 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
USP35Q9P2H5 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
USP35Q9P2H5 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
USP35Q9P2H5 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
USP35Q9P2H5 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
USP35Q9P2H5 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
USP35Q9P2H5 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
USP35Q9P2H5 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
USP35Q9P2H5 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
USP35Q9P2H5 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
USP35Q9P2H5 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
USP35Q9P2H5 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
USP35Q9P2H5 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
USP35Q9P2H5 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
USP35Q9P2H5 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
USP35Q9P2H5 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
USP35Q9P2H5 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
USP35Q9P2H5 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
USP35Q9P2H5 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
USP35Q9P2H5 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC25.01■■□□□ 1.59
USP35Q9P2H5 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
USP35Q9P2H5 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
USP35Q9P2H5 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
USP35Q9P2H5 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
USP35Q9P2H5 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
USP35Q9P2H5 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
USP35Q9P2H5 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
USP35Q9P2H5 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
USP35Q9P2H5 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
USP35Q9P2H5 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
USP35Q9P2H5 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
USP35Q9P2H5 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
USP35Q9P2H5 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
USP35Q9P2H5 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC25■■□□□ 1.59
USP35Q9P2H5 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
USP35Q9P2H5 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
USP35Q9P2H5 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
USP35Q9P2H5 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
USP35Q9P2H5 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC25■■□□□ 1.59
USP35Q9P2H5 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC25■■□□□ 1.59
USP35Q9P2H5 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
USP35Q9P2H5 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
USP35Q9P2H5 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
USP35Q9P2H5 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
USP35Q9P2H5 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
USP35Q9P2H5 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
USP35Q9P2H5 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC25■■□□□ 1.59
USP35Q9P2H5 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
USP35Q9P2H5 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC25■■□□□ 1.59
USP35Q9P2H5 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
USP35Q9P2H5 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
USP35Q9P2H5 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
USP35Q9P2H5 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
USP35Q9P2H5 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
USP35Q9P2H5 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
USP35Q9P2H5 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
USP35Q9P2H5 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
USP35Q9P2H5 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
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