Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2A4

ABI3, ABI gene family member 3, humanhuman

Predictions only

Length 366 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABI3Q9P2A4 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ABI3Q9P2A4 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ABI3Q9P2A4 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ABI3Q9P2A4 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ABI3Q9P2A4 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ABI3Q9P2A4 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ABI3Q9P2A4 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
ABI3Q9P2A4 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
ABI3Q9P2A4 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
ABI3Q9P2A4 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ABI3Q9P2A4 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ABI3Q9P2A4 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ABI3Q9P2A4 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ABI3Q9P2A4 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ABI3Q9P2A4 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ABI3Q9P2A4 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ABI3Q9P2A4 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ABI3Q9P2A4 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ABI3Q9P2A4 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ABI3Q9P2A4 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ABI3Q9P2A4 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ABI3Q9P2A4 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ABI3Q9P2A4 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ABI3Q9P2A4 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ABI3Q9P2A4 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ABI3Q9P2A4 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ABI3Q9P2A4 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ABI3Q9P2A4 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ABI3Q9P2A4 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ABI3Q9P2A4 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ABI3Q9P2A4 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ABI3Q9P2A4 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ABI3Q9P2A4 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ABI3Q9P2A4 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ABI3Q9P2A4 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ABI3Q9P2A4 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ABI3Q9P2A4 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ABI3Q9P2A4 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ABI3Q9P2A4 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
ABI3Q9P2A4 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ABI3Q9P2A4 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ABI3Q9P2A4 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ABI3Q9P2A4 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
ABI3Q9P2A4 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ABI3Q9P2A4 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ABI3Q9P2A4 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ABI3Q9P2A4 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ABI3Q9P2A4 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ABI3Q9P2A4 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ABI3Q9P2A4 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ABI3Q9P2A4 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ABI3Q9P2A4 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ABI3Q9P2A4 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ABI3Q9P2A4 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ABI3Q9P2A4 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
ABI3Q9P2A4 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
ABI3Q9P2A4 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ABI3Q9P2A4 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ABI3Q9P2A4 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ABI3Q9P2A4 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ABI3Q9P2A4 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
ABI3Q9P2A4 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ABI3Q9P2A4 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ABI3Q9P2A4 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ABI3Q9P2A4 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ABI3Q9P2A4 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
ABI3Q9P2A4 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ABI3Q9P2A4 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
ABI3Q9P2A4 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
ABI3Q9P2A4 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
ABI3Q9P2A4 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ABI3Q9P2A4 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ABI3Q9P2A4 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ABI3Q9P2A4 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ABI3Q9P2A4 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ABI3Q9P2A4 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ABI3Q9P2A4 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ABI3Q9P2A4 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ABI3Q9P2A4 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ABI3Q9P2A4 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ABI3Q9P2A4 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ABI3Q9P2A4 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
ABI3Q9P2A4 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ABI3Q9P2A4 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ABI3Q9P2A4 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ABI3Q9P2A4 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ABI3Q9P2A4 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
ABI3Q9P2A4 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ABI3Q9P2A4 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ABI3Q9P2A4 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ABI3Q9P2A4 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ABI3Q9P2A4 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ABI3Q9P2A4 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ABI3Q9P2A4 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ABI3Q9P2A4 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ABI3Q9P2A4 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ABI3Q9P2A4 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ABI3Q9P2A4 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ABI3Q9P2A4 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ABI3Q9P2A4 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms