Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z9

CCDC180, Coiled-coil domain-containing protein 180, humanhuman

Predictions only

Length 1,646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC180Q9P1Z9 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
CCDC180Q9P1Z9 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC37.85■■■■□ 3.65
CCDC180Q9P1Z9 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.85■■■■□ 3.65
CCDC180Q9P1Z9 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
CCDC180Q9P1Z9 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
CCDC180Q9P1Z9 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
CCDC180Q9P1Z9 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.84■■■■□ 3.65
CCDC180Q9P1Z9 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
CCDC180Q9P1Z9 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC37.83■■■■□ 3.65
CCDC180Q9P1Z9 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC37.83■■■■□ 3.65
CCDC180Q9P1Z9 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
CCDC180Q9P1Z9 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
CCDC180Q9P1Z9 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
CCDC180Q9P1Z9 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
CCDC180Q9P1Z9 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
CCDC180Q9P1Z9 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
CCDC180Q9P1Z9 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
CCDC180Q9P1Z9 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
CCDC180Q9P1Z9 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
CCDC180Q9P1Z9 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC37.83■■■■□ 3.65
CCDC180Q9P1Z9 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC37.83■■■■□ 3.65
CCDC180Q9P1Z9 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC37.82■■■■□ 3.65
CCDC180Q9P1Z9 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.82■■■■□ 3.65
CCDC180Q9P1Z9 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC37.82■■■■□ 3.65
CCDC180Q9P1Z9 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC37.82■■■■□ 3.65
CCDC180Q9P1Z9 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.82■■■■□ 3.64
CCDC180Q9P1Z9 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC37.82■■■■□ 3.64
CCDC180Q9P1Z9 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC37.82■■■■□ 3.64
CCDC180Q9P1Z9 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.82■■■■□ 3.64
CCDC180Q9P1Z9 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC37.82■■■■□ 3.64
CCDC180Q9P1Z9 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.82■■■■□ 3.64
CCDC180Q9P1Z9 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC37.81■■■■□ 3.64
CCDC180Q9P1Z9 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC37.81■■■■□ 3.64
CCDC180Q9P1Z9 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC37.81■■■■□ 3.64
CCDC180Q9P1Z9 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.81■■■■□ 3.64
CCDC180Q9P1Z9 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC37.81■■■■□ 3.64
CCDC180Q9P1Z9 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC37.81■■■■□ 3.64
CCDC180Q9P1Z9 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
CCDC180Q9P1Z9 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
CCDC180Q9P1Z9 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
CCDC180Q9P1Z9 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC37.8■■■■□ 3.64
CCDC180Q9P1Z9 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC37.8■■■■□ 3.64
CCDC180Q9P1Z9 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
CCDC180Q9P1Z9 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
CCDC180Q9P1Z9 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC37.8■■■■□ 3.64
CCDC180Q9P1Z9 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
CCDC180Q9P1Z9 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
CCDC180Q9P1Z9 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC37.8■■■■□ 3.64
CCDC180Q9P1Z9 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
CCDC180Q9P1Z9 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC37.79■■■■□ 3.64
CCDC180Q9P1Z9 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
CCDC180Q9P1Z9 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
CCDC180Q9P1Z9 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
CCDC180Q9P1Z9 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC37.79■■■■□ 3.64
CCDC180Q9P1Z9 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC37.79■■■■□ 3.64
CCDC180Q9P1Z9 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC37.79■■■■□ 3.64
CCDC180Q9P1Z9 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC37.79■■■■□ 3.64
CCDC180Q9P1Z9 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC37.79■■■■□ 3.64
CCDC180Q9P1Z9 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC37.79■■■■□ 3.64
CCDC180Q9P1Z9 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
CCDC180Q9P1Z9 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC37.78■■■■□ 3.64
CCDC180Q9P1Z9 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC37.78■■■■□ 3.64
CCDC180Q9P1Z9 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC37.78■■■■□ 3.64
CCDC180Q9P1Z9 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC37.78■■■■□ 3.64
CCDC180Q9P1Z9 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC37.78■■■■□ 3.64
CCDC180Q9P1Z9 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.78■■■■□ 3.64
CCDC180Q9P1Z9 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.78■■■■□ 3.64
CCDC180Q9P1Z9 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC37.78■■■■□ 3.64
CCDC180Q9P1Z9 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC37.78■■■■□ 3.64
CCDC180Q9P1Z9 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.78■■■■□ 3.64
CCDC180Q9P1Z9 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC37.77■■■■□ 3.64
CCDC180Q9P1Z9 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
CCDC180Q9P1Z9 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC37.77■■■■□ 3.64
CCDC180Q9P1Z9 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC37.77■■■■□ 3.64
CCDC180Q9P1Z9 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
CCDC180Q9P1Z9 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.64
CCDC180Q9P1Z9 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.64
CCDC180Q9P1Z9 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.64
CCDC180Q9P1Z9 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC37.76■■■■□ 3.64
CCDC180Q9P1Z9 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.64
CCDC180Q9P1Z9 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC37.76■■■■□ 3.64
CCDC180Q9P1Z9 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.64
CCDC180Q9P1Z9 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.76■■■■□ 3.64
CCDC180Q9P1Z9 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.76■■■■□ 3.64
CCDC180Q9P1Z9 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC37.76■■■■□ 3.64
CCDC180Q9P1Z9 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC37.76■■■■□ 3.63
CCDC180Q9P1Z9 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.63
CCDC180Q9P1Z9 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC37.76■■■■□ 3.63
CCDC180Q9P1Z9 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC37.76■■■■□ 3.63
CCDC180Q9P1Z9 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC37.76■■■■□ 3.63
CCDC180Q9P1Z9 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC37.76■■■■□ 3.63
CCDC180Q9P1Z9 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC37.76■■■■□ 3.63
CCDC180Q9P1Z9 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.75■■■■□ 3.63
CCDC180Q9P1Z9 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC37.75■■■■□ 3.63
CCDC180Q9P1Z9 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.75■■■■□ 3.63
CCDC180Q9P1Z9 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC37.75■■■■□ 3.63
CCDC180Q9P1Z9 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC37.75■■■■□ 3.63
CCDC180Q9P1Z9 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC37.75■■■■□ 3.63
CCDC180Q9P1Z9 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC37.75■■■■□ 3.63
CCDC180Q9P1Z9 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.75■■■■□ 3.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms