Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1U0

ZNRD1, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA12, humanhuman

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNRD1Q9P1U0 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNRD1Q9P1U0 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNRD1Q9P1U0 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNRD1Q9P1U0 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNRD1Q9P1U0 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNRD1Q9P1U0 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNRD1Q9P1U0 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNRD1Q9P1U0 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNRD1Q9P1U0 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNRD1Q9P1U0 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNRD1Q9P1U0 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNRD1Q9P1U0 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNRD1Q9P1U0 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNRD1Q9P1U0 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNRD1Q9P1U0 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNRD1Q9P1U0 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNRD1Q9P1U0 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNRD1Q9P1U0 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNRD1Q9P1U0 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNRD1Q9P1U0 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNRD1Q9P1U0 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNRD1Q9P1U0 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNRD1Q9P1U0 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNRD1Q9P1U0 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNRD1Q9P1U0 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNRD1Q9P1U0 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNRD1Q9P1U0 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNRD1Q9P1U0 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNRD1Q9P1U0 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNRD1Q9P1U0 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNRD1Q9P1U0 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNRD1Q9P1U0 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNRD1Q9P1U0 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNRD1Q9P1U0 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNRD1Q9P1U0 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNRD1Q9P1U0 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNRD1Q9P1U0 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNRD1Q9P1U0 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNRD1Q9P1U0 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNRD1Q9P1U0 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNRD1Q9P1U0 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNRD1Q9P1U0 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNRD1Q9P1U0 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNRD1Q9P1U0 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNRD1Q9P1U0 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNRD1Q9P1U0 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNRD1Q9P1U0 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNRD1Q9P1U0 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNRD1Q9P1U0 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNRD1Q9P1U0 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNRD1Q9P1U0 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNRD1Q9P1U0 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNRD1Q9P1U0 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNRD1Q9P1U0 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNRD1Q9P1U0 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNRD1Q9P1U0 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNRD1Q9P1U0 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNRD1Q9P1U0 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNRD1Q9P1U0 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNRD1Q9P1U0 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNRD1Q9P1U0 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNRD1Q9P1U0 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNRD1Q9P1U0 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNRD1Q9P1U0 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNRD1Q9P1U0 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNRD1Q9P1U0 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNRD1Q9P1U0 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNRD1Q9P1U0 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNRD1Q9P1U0 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNRD1Q9P1U0 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNRD1Q9P1U0 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNRD1Q9P1U0 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNRD1Q9P1U0 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNRD1Q9P1U0 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNRD1Q9P1U0 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNRD1Q9P1U0 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNRD1Q9P1U0 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNRD1Q9P1U0 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNRD1Q9P1U0 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNRD1Q9P1U0 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNRD1Q9P1U0 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNRD1Q9P1U0 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNRD1Q9P1U0 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNRD1Q9P1U0 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNRD1Q9P1U0 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNRD1Q9P1U0 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNRD1Q9P1U0 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNRD1Q9P1U0 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNRD1Q9P1U0 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNRD1Q9P1U0 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNRD1Q9P1U0 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNRD1Q9P1U0 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNRD1Q9P1U0 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNRD1Q9P1U0 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNRD1Q9P1U0 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNRD1Q9P1U0 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNRD1Q9P1U0 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNRD1Q9P1U0 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNRD1Q9P1U0 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNRD1Q9P1U0 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.8 ms