Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZI2

KCNIP1, Kv channel-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNIP1Q9NZI2 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
KCNIP1Q9NZI2 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
KCNIP1Q9NZI2 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KCNIP1Q9NZI2 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KCNIP1Q9NZI2 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KCNIP1Q9NZI2 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KCNIP1Q9NZI2 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
KCNIP1Q9NZI2 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KCNIP1Q9NZI2 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KCNIP1Q9NZI2 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KCNIP1Q9NZI2 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KCNIP1Q9NZI2 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KCNIP1Q9NZI2 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KCNIP1Q9NZI2 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KCNIP1Q9NZI2 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KCNIP1Q9NZI2 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KCNIP1Q9NZI2 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KCNIP1Q9NZI2 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KCNIP1Q9NZI2 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KCNIP1Q9NZI2 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
KCNIP1Q9NZI2 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KCNIP1Q9NZI2 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KCNIP1Q9NZI2 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KCNIP1Q9NZI2 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KCNIP1Q9NZI2 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KCNIP1Q9NZI2 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
KCNIP1Q9NZI2 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KCNIP1Q9NZI2 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
KCNIP1Q9NZI2 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KCNIP1Q9NZI2 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KCNIP1Q9NZI2 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KCNIP1Q9NZI2 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KCNIP1Q9NZI2 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KCNIP1Q9NZI2 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KCNIP1Q9NZI2 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KCNIP1Q9NZI2 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KCNIP1Q9NZI2 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KCNIP1Q9NZI2 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KCNIP1Q9NZI2 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KCNIP1Q9NZI2 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KCNIP1Q9NZI2 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KCNIP1Q9NZI2 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KCNIP1Q9NZI2 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KCNIP1Q9NZI2 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KCNIP1Q9NZI2 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KCNIP1Q9NZI2 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KCNIP1Q9NZI2 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KCNIP1Q9NZI2 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KCNIP1Q9NZI2 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KCNIP1Q9NZI2 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KCNIP1Q9NZI2 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KCNIP1Q9NZI2 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
KCNIP1Q9NZI2 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KCNIP1Q9NZI2 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KCNIP1Q9NZI2 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KCNIP1Q9NZI2 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KCNIP1Q9NZI2 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KCNIP1Q9NZI2 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KCNIP1Q9NZI2 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KCNIP1Q9NZI2 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KCNIP1Q9NZI2 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KCNIP1Q9NZI2 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KCNIP1Q9NZI2 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KCNIP1Q9NZI2 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
KCNIP1Q9NZI2 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KCNIP1Q9NZI2 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KCNIP1Q9NZI2 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KCNIP1Q9NZI2 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KCNIP1Q9NZI2 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KCNIP1Q9NZI2 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KCNIP1Q9NZI2 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KCNIP1Q9NZI2 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KCNIP1Q9NZI2 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KCNIP1Q9NZI2 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KCNIP1Q9NZI2 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KCNIP1Q9NZI2 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KCNIP1Q9NZI2 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KCNIP1Q9NZI2 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KCNIP1Q9NZI2 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
KCNIP1Q9NZI2 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KCNIP1Q9NZI2 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KCNIP1Q9NZI2 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KCNIP1Q9NZI2 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KCNIP1Q9NZI2 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KCNIP1Q9NZI2 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KCNIP1Q9NZI2 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KCNIP1Q9NZI2 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
KCNIP1Q9NZI2 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KCNIP1Q9NZI2 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KCNIP1Q9NZI2 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KCNIP1Q9NZI2 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KCNIP1Q9NZI2 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KCNIP1Q9NZI2 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KCNIP1Q9NZI2 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KCNIP1Q9NZI2 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KCNIP1Q9NZI2 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KCNIP1Q9NZI2 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
KCNIP1Q9NZI2 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KCNIP1Q9NZI2 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KCNIP1Q9NZI2 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms