Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXS3

KLHL28, Kelch-like protein 28, humanhuman

Predictions only

Length 571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL28Q9NXS3 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KLHL28Q9NXS3 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
KLHL28Q9NXS3 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KLHL28Q9NXS3 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KLHL28Q9NXS3 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
KLHL28Q9NXS3 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
KLHL28Q9NXS3 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
KLHL28Q9NXS3 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
KLHL28Q9NXS3 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
KLHL28Q9NXS3 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
KLHL28Q9NXS3 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
KLHL28Q9NXS3 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
KLHL28Q9NXS3 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
KLHL28Q9NXS3 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
KLHL28Q9NXS3 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KLHL28Q9NXS3 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KLHL28Q9NXS3 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KLHL28Q9NXS3 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
KLHL28Q9NXS3 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KLHL28Q9NXS3 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KLHL28Q9NXS3 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KLHL28Q9NXS3 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KLHL28Q9NXS3 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KLHL28Q9NXS3 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KLHL28Q9NXS3 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KLHL28Q9NXS3 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KLHL28Q9NXS3 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KLHL28Q9NXS3 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KLHL28Q9NXS3 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KLHL28Q9NXS3 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KLHL28Q9NXS3 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KLHL28Q9NXS3 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KLHL28Q9NXS3 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KLHL28Q9NXS3 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KLHL28Q9NXS3 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
KLHL28Q9NXS3 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KLHL28Q9NXS3 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KLHL28Q9NXS3 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KLHL28Q9NXS3 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KLHL28Q9NXS3 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KLHL28Q9NXS3 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KLHL28Q9NXS3 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KLHL28Q9NXS3 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KLHL28Q9NXS3 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KLHL28Q9NXS3 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KLHL28Q9NXS3 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KLHL28Q9NXS3 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KLHL28Q9NXS3 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KLHL28Q9NXS3 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KLHL28Q9NXS3 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
KLHL28Q9NXS3 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KLHL28Q9NXS3 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KLHL28Q9NXS3 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KLHL28Q9NXS3 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KLHL28Q9NXS3 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KLHL28Q9NXS3 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KLHL28Q9NXS3 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KLHL28Q9NXS3 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KLHL28Q9NXS3 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KLHL28Q9NXS3 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KLHL28Q9NXS3 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
KLHL28Q9NXS3 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
KLHL28Q9NXS3 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
KLHL28Q9NXS3 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KLHL28Q9NXS3 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KLHL28Q9NXS3 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KLHL28Q9NXS3 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KLHL28Q9NXS3 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KLHL28Q9NXS3 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
KLHL28Q9NXS3 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KLHL28Q9NXS3 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KLHL28Q9NXS3 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KLHL28Q9NXS3 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KLHL28Q9NXS3 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KLHL28Q9NXS3 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
KLHL28Q9NXS3 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KLHL28Q9NXS3 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
KLHL28Q9NXS3 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KLHL28Q9NXS3 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KLHL28Q9NXS3 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KLHL28Q9NXS3 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KLHL28Q9NXS3 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KLHL28Q9NXS3 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KLHL28Q9NXS3 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
KLHL28Q9NXS3 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
KLHL28Q9NXS3 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
KLHL28Q9NXS3 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
KLHL28Q9NXS3 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
KLHL28Q9NXS3 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
KLHL28Q9NXS3 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
KLHL28Q9NXS3 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
KLHL28Q9NXS3 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
KLHL28Q9NXS3 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
KLHL28Q9NXS3 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
KLHL28Q9NXS3 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
KLHL28Q9NXS3 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
KLHL28Q9NXS3 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
KLHL28Q9NXS3 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
KLHL28Q9NXS3 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
KLHL28Q9NXS3 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms