Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXJ0

MS4A12, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 12, humanhuman

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A12Q9NXJ0 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
MS4A12Q9NXJ0 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
MS4A12Q9NXJ0 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
MS4A12Q9NXJ0 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
MS4A12Q9NXJ0 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
MS4A12Q9NXJ0 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
MS4A12Q9NXJ0 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
MS4A12Q9NXJ0 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
MS4A12Q9NXJ0 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
MS4A12Q9NXJ0 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
MS4A12Q9NXJ0 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
MS4A12Q9NXJ0 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
MS4A12Q9NXJ0 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
MS4A12Q9NXJ0 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
MS4A12Q9NXJ0 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
MS4A12Q9NXJ0 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
MS4A12Q9NXJ0 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
MS4A12Q9NXJ0 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
MS4A12Q9NXJ0 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
MS4A12Q9NXJ0 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
MS4A12Q9NXJ0 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
MS4A12Q9NXJ0 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
MS4A12Q9NXJ0 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
MS4A12Q9NXJ0 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
MS4A12Q9NXJ0 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
MS4A12Q9NXJ0 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
MS4A12Q9NXJ0 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
MS4A12Q9NXJ0 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
MS4A12Q9NXJ0 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
MS4A12Q9NXJ0 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
MS4A12Q9NXJ0 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
MS4A12Q9NXJ0 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
MS4A12Q9NXJ0 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
MS4A12Q9NXJ0 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
MS4A12Q9NXJ0 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
MS4A12Q9NXJ0 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
MS4A12Q9NXJ0 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
MS4A12Q9NXJ0 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
MS4A12Q9NXJ0 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
MS4A12Q9NXJ0 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
MS4A12Q9NXJ0 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
MS4A12Q9NXJ0 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
MS4A12Q9NXJ0 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
MS4A12Q9NXJ0 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
MS4A12Q9NXJ0 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
MS4A12Q9NXJ0 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
MS4A12Q9NXJ0 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
MS4A12Q9NXJ0 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
MS4A12Q9NXJ0 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
MS4A12Q9NXJ0 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
MS4A12Q9NXJ0 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
MS4A12Q9NXJ0 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
MS4A12Q9NXJ0 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
MS4A12Q9NXJ0 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
MS4A12Q9NXJ0 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
MS4A12Q9NXJ0 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
MS4A12Q9NXJ0 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
MS4A12Q9NXJ0 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
MS4A12Q9NXJ0 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
MS4A12Q9NXJ0 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
MS4A12Q9NXJ0 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
MS4A12Q9NXJ0 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
MS4A12Q9NXJ0 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
MS4A12Q9NXJ0 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
MS4A12Q9NXJ0 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
MS4A12Q9NXJ0 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
MS4A12Q9NXJ0 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
MS4A12Q9NXJ0 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
MS4A12Q9NXJ0 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
MS4A12Q9NXJ0 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
MS4A12Q9NXJ0 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
MS4A12Q9NXJ0 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
MS4A12Q9NXJ0 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
MS4A12Q9NXJ0 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
MS4A12Q9NXJ0 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
MS4A12Q9NXJ0 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
MS4A12Q9NXJ0 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
MS4A12Q9NXJ0 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
MS4A12Q9NXJ0 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
MS4A12Q9NXJ0 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
MS4A12Q9NXJ0 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
MS4A12Q9NXJ0 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
MS4A12Q9NXJ0 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
MS4A12Q9NXJ0 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
MS4A12Q9NXJ0 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
MS4A12Q9NXJ0 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
MS4A12Q9NXJ0 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
MS4A12Q9NXJ0 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
MS4A12Q9NXJ0 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
MS4A12Q9NXJ0 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
MS4A12Q9NXJ0 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
MS4A12Q9NXJ0 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
MS4A12Q9NXJ0 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
MS4A12Q9NXJ0 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
MS4A12Q9NXJ0 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
MS4A12Q9NXJ0 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
MS4A12Q9NXJ0 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
MS4A12Q9NXJ0 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
MS4A12Q9NXJ0 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
MS4A12Q9NXJ0 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms