Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXH9

TRMT1, tRNA (guanine(26)-N(2))-dimethyltransferase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 659 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRMT1Q9NXH9 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRMT1Q9NXH9 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRMT1Q9NXH9 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRMT1Q9NXH9 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRMT1Q9NXH9 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRMT1Q9NXH9 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
TRMT1Q9NXH9 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
TRMT1Q9NXH9 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
TRMT1Q9NXH9 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
TRMT1Q9NXH9 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
TRMT1Q9NXH9 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRMT1Q9NXH9 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRMT1Q9NXH9 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRMT1Q9NXH9 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRMT1Q9NXH9 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRMT1Q9NXH9 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRMT1Q9NXH9 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRMT1Q9NXH9 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRMT1Q9NXH9 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRMT1Q9NXH9 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRMT1Q9NXH9 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRMT1Q9NXH9 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRMT1Q9NXH9 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRMT1Q9NXH9 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRMT1Q9NXH9 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRMT1Q9NXH9 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRMT1Q9NXH9 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRMT1Q9NXH9 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRMT1Q9NXH9 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRMT1Q9NXH9 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRMT1Q9NXH9 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRMT1Q9NXH9 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRMT1Q9NXH9 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRMT1Q9NXH9 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRMT1Q9NXH9 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRMT1Q9NXH9 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRMT1Q9NXH9 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRMT1Q9NXH9 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRMT1Q9NXH9 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRMT1Q9NXH9 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRMT1Q9NXH9 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRMT1Q9NXH9 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRMT1Q9NXH9 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRMT1Q9NXH9 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRMT1Q9NXH9 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRMT1Q9NXH9 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRMT1Q9NXH9 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRMT1Q9NXH9 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRMT1Q9NXH9 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRMT1Q9NXH9 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRMT1Q9NXH9 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRMT1Q9NXH9 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRMT1Q9NXH9 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRMT1Q9NXH9 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRMT1Q9NXH9 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRMT1Q9NXH9 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRMT1Q9NXH9 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRMT1Q9NXH9 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRMT1Q9NXH9 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRMT1Q9NXH9 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRMT1Q9NXH9 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRMT1Q9NXH9 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRMT1Q9NXH9 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRMT1Q9NXH9 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRMT1Q9NXH9 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRMT1Q9NXH9 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRMT1Q9NXH9 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRMT1Q9NXH9 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRMT1Q9NXH9 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRMT1Q9NXH9 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRMT1Q9NXH9 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRMT1Q9NXH9 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRMT1Q9NXH9 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRMT1Q9NXH9 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRMT1Q9NXH9 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRMT1Q9NXH9 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRMT1Q9NXH9 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRMT1Q9NXH9 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRMT1Q9NXH9 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRMT1Q9NXH9 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRMT1Q9NXH9 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRMT1Q9NXH9 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRMT1Q9NXH9 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRMT1Q9NXH9 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRMT1Q9NXH9 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRMT1Q9NXH9 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRMT1Q9NXH9 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.83
TRMT1Q9NXH9 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.83
TRMT1Q9NXH9 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRMT1Q9NXH9 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRMT1Q9NXH9 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRMT1Q9NXH9 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRMT1Q9NXH9 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRMT1Q9NXH9 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRMT1Q9NXH9 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRMT1Q9NXH9 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRMT1Q9NXH9 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRMT1Q9NXH9 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRMT1Q9NXH9 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRMT1Q9NXH9 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms