Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUV7

SPTLC3, Serine palmitoyltransferase 3, humanhuman

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTLC3Q9NUV7 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SPTLC3Q9NUV7 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SPTLC3Q9NUV7 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SPTLC3Q9NUV7 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SPTLC3Q9NUV7 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SPTLC3Q9NUV7 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SPTLC3Q9NUV7 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SPTLC3Q9NUV7 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SPTLC3Q9NUV7 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
SPTLC3Q9NUV7 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SPTLC3Q9NUV7 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SPTLC3Q9NUV7 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SPTLC3Q9NUV7 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SPTLC3Q9NUV7 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SPTLC3Q9NUV7 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SPTLC3Q9NUV7 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SPTLC3Q9NUV7 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SPTLC3Q9NUV7 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SPTLC3Q9NUV7 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SPTLC3Q9NUV7 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SPTLC3Q9NUV7 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SPTLC3Q9NUV7 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SPTLC3Q9NUV7 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SPTLC3Q9NUV7 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SPTLC3Q9NUV7 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SPTLC3Q9NUV7 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
SPTLC3Q9NUV7 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SPTLC3Q9NUV7 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SPTLC3Q9NUV7 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SPTLC3Q9NUV7 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SPTLC3Q9NUV7 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SPTLC3Q9NUV7 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SPTLC3Q9NUV7 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SPTLC3Q9NUV7 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SPTLC3Q9NUV7 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SPTLC3Q9NUV7 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SPTLC3Q9NUV7 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SPTLC3Q9NUV7 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SPTLC3Q9NUV7 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SPTLC3Q9NUV7 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SPTLC3Q9NUV7 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SPTLC3Q9NUV7 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SPTLC3Q9NUV7 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SPTLC3Q9NUV7 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SPTLC3Q9NUV7 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SPTLC3Q9NUV7 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SPTLC3Q9NUV7 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SPTLC3Q9NUV7 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SPTLC3Q9NUV7 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SPTLC3Q9NUV7 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SPTLC3Q9NUV7 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SPTLC3Q9NUV7 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SPTLC3Q9NUV7 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SPTLC3Q9NUV7 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
SPTLC3Q9NUV7 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SPTLC3Q9NUV7 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SPTLC3Q9NUV7 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SPTLC3Q9NUV7 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SPTLC3Q9NUV7 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SPTLC3Q9NUV7 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SPTLC3Q9NUV7 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SPTLC3Q9NUV7 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SPTLC3Q9NUV7 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SPTLC3Q9NUV7 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SPTLC3Q9NUV7 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SPTLC3Q9NUV7 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SPTLC3Q9NUV7 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SPTLC3Q9NUV7 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SPTLC3Q9NUV7 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SPTLC3Q9NUV7 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SPTLC3Q9NUV7 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SPTLC3Q9NUV7 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
SPTLC3Q9NUV7 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SPTLC3Q9NUV7 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SPTLC3Q9NUV7 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SPTLC3Q9NUV7 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SPTLC3Q9NUV7 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SPTLC3Q9NUV7 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SPTLC3Q9NUV7 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SPTLC3Q9NUV7 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SPTLC3Q9NUV7 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SPTLC3Q9NUV7 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SPTLC3Q9NUV7 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SPTLC3Q9NUV7 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SPTLC3Q9NUV7 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SPTLC3Q9NUV7 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SPTLC3Q9NUV7 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SPTLC3Q9NUV7 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SPTLC3Q9NUV7 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SPTLC3Q9NUV7 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SPTLC3Q9NUV7 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SPTLC3Q9NUV7 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SPTLC3Q9NUV7 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SPTLC3Q9NUV7 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SPTLC3Q9NUV7 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SPTLC3Q9NUV7 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SPTLC3Q9NUV7 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
SPTLC3Q9NUV7 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SPTLC3Q9NUV7 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SPTLC3Q9NUV7 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms