Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUM4

TMEM106B, Transmembrane protein 106B, humanhuman

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM106BQ9NUM4 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM106BQ9NUM4 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM106BQ9NUM4 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM106BQ9NUM4 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM106BQ9NUM4 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM106BQ9NUM4 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM106BQ9NUM4 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM106BQ9NUM4 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM106BQ9NUM4 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM106BQ9NUM4 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM106BQ9NUM4 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM106BQ9NUM4 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM106BQ9NUM4 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM106BQ9NUM4 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM106BQ9NUM4 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMEM106BQ9NUM4 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMEM106BQ9NUM4 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMEM106BQ9NUM4 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMEM106BQ9NUM4 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMEM106BQ9NUM4 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMEM106BQ9NUM4 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMEM106BQ9NUM4 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMEM106BQ9NUM4 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMEM106BQ9NUM4 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMEM106BQ9NUM4 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMEM106BQ9NUM4 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMEM106BQ9NUM4 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMEM106BQ9NUM4 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMEM106BQ9NUM4 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMEM106BQ9NUM4 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMEM106BQ9NUM4 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMEM106BQ9NUM4 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMEM106BQ9NUM4 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMEM106BQ9NUM4 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMEM106BQ9NUM4 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMEM106BQ9NUM4 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMEM106BQ9NUM4 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMEM106BQ9NUM4 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMEM106BQ9NUM4 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMEM106BQ9NUM4 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
TMEM106BQ9NUM4 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
TMEM106BQ9NUM4 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMEM106BQ9NUM4 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMEM106BQ9NUM4 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMEM106BQ9NUM4 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMEM106BQ9NUM4 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
TMEM106BQ9NUM4 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMEM106BQ9NUM4 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMEM106BQ9NUM4 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
TMEM106BQ9NUM4 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
TMEM106BQ9NUM4 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TMEM106BQ9NUM4 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TMEM106BQ9NUM4 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TMEM106BQ9NUM4 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TMEM106BQ9NUM4 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TMEM106BQ9NUM4 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TMEM106BQ9NUM4 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TMEM106BQ9NUM4 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
TMEM106BQ9NUM4 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TMEM106BQ9NUM4 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TMEM106BQ9NUM4 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TMEM106BQ9NUM4 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TMEM106BQ9NUM4 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TMEM106BQ9NUM4 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TMEM106BQ9NUM4 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TMEM106BQ9NUM4 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TMEM106BQ9NUM4 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TMEM106BQ9NUM4 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TMEM106BQ9NUM4 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
TMEM106BQ9NUM4 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TMEM106BQ9NUM4 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TMEM106BQ9NUM4 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TMEM106BQ9NUM4 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TMEM106BQ9NUM4 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TMEM106BQ9NUM4 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
TMEM106BQ9NUM4 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TMEM106BQ9NUM4 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TMEM106BQ9NUM4 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TMEM106BQ9NUM4 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TMEM106BQ9NUM4 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TMEM106BQ9NUM4 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
TMEM106BQ9NUM4 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TMEM106BQ9NUM4 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TMEM106BQ9NUM4 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TMEM106BQ9NUM4 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TMEM106BQ9NUM4 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TMEM106BQ9NUM4 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TMEM106BQ9NUM4 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
TMEM106BQ9NUM4 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TMEM106BQ9NUM4 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TMEM106BQ9NUM4 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TMEM106BQ9NUM4 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TMEM106BQ9NUM4 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
TMEM106BQ9NUM4 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TMEM106BQ9NUM4 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TMEM106BQ9NUM4 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TMEM106BQ9NUM4 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TMEM106BQ9NUM4 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TMEM106BQ9NUM4 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TMEM106BQ9NUM4 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms