Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRB3

CHST12, Carbohydrate sulfotransferase 12, humanhuman

Predictions only

Length 414 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHST12Q9NRB3 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHST12Q9NRB3 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHST12Q9NRB3 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHST12Q9NRB3 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHST12Q9NRB3 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHST12Q9NRB3 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHST12Q9NRB3 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHST12Q9NRB3 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHST12Q9NRB3 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHST12Q9NRB3 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CHST12Q9NRB3 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHST12Q9NRB3 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHST12Q9NRB3 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CHST12Q9NRB3 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CHST12Q9NRB3 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHST12Q9NRB3 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHST12Q9NRB3 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHST12Q9NRB3 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHST12Q9NRB3 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHST12Q9NRB3 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHST12Q9NRB3 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHST12Q9NRB3 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHST12Q9NRB3 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHST12Q9NRB3 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHST12Q9NRB3 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHST12Q9NRB3 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHST12Q9NRB3 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHST12Q9NRB3 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHST12Q9NRB3 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHST12Q9NRB3 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHST12Q9NRB3 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHST12Q9NRB3 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHST12Q9NRB3 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHST12Q9NRB3 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHST12Q9NRB3 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHST12Q9NRB3 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHST12Q9NRB3 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHST12Q9NRB3 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHST12Q9NRB3 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CHST12Q9NRB3 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHST12Q9NRB3 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHST12Q9NRB3 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CHST12Q9NRB3 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHST12Q9NRB3 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHST12Q9NRB3 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHST12Q9NRB3 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHST12Q9NRB3 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHST12Q9NRB3 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHST12Q9NRB3 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHST12Q9NRB3 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CHST12Q9NRB3 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHST12Q9NRB3 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHST12Q9NRB3 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHST12Q9NRB3 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHST12Q9NRB3 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHST12Q9NRB3 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHST12Q9NRB3 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHST12Q9NRB3 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHST12Q9NRB3 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHST12Q9NRB3 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHST12Q9NRB3 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHST12Q9NRB3 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHST12Q9NRB3 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHST12Q9NRB3 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHST12Q9NRB3 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CHST12Q9NRB3 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHST12Q9NRB3 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHST12Q9NRB3 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHST12Q9NRB3 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHST12Q9NRB3 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHST12Q9NRB3 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHST12Q9NRB3 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHST12Q9NRB3 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHST12Q9NRB3 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHST12Q9NRB3 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHST12Q9NRB3 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHST12Q9NRB3 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHST12Q9NRB3 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHST12Q9NRB3 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHST12Q9NRB3 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHST12Q9NRB3 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHST12Q9NRB3 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHST12Q9NRB3 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHST12Q9NRB3 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHST12Q9NRB3 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHST12Q9NRB3 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHST12Q9NRB3 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHST12Q9NRB3 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHST12Q9NRB3 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHST12Q9NRB3 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHST12Q9NRB3 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHST12Q9NRB3 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHST12Q9NRB3 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHST12Q9NRB3 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CHST12Q9NRB3 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CHST12Q9NRB3 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CHST12Q9NRB3 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CHST12Q9NRB3 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CHST12Q9NRB3 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CHST12Q9NRB3 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms