Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ35

NRIP3, Nuclear receptor-interacting protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRIP3Q9NQ35 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NRIP3Q9NQ35 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NRIP3Q9NQ35 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NRIP3Q9NQ35 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NRIP3Q9NQ35 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NRIP3Q9NQ35 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NRIP3Q9NQ35 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NRIP3Q9NQ35 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NRIP3Q9NQ35 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NRIP3Q9NQ35 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NRIP3Q9NQ35 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
NRIP3Q9NQ35 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NRIP3Q9NQ35 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NRIP3Q9NQ35 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NRIP3Q9NQ35 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
NRIP3Q9NQ35 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NRIP3Q9NQ35 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NRIP3Q9NQ35 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NRIP3Q9NQ35 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NRIP3Q9NQ35 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
NRIP3Q9NQ35 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NRIP3Q9NQ35 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NRIP3Q9NQ35 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NRIP3Q9NQ35 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NRIP3Q9NQ35 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NRIP3Q9NQ35 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NRIP3Q9NQ35 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NRIP3Q9NQ35 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NRIP3Q9NQ35 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NRIP3Q9NQ35 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NRIP3Q9NQ35 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NRIP3Q9NQ35 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NRIP3Q9NQ35 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NRIP3Q9NQ35 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NRIP3Q9NQ35 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NRIP3Q9NQ35 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NRIP3Q9NQ35 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NRIP3Q9NQ35 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NRIP3Q9NQ35 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NRIP3Q9NQ35 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NRIP3Q9NQ35 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NRIP3Q9NQ35 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NRIP3Q9NQ35 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NRIP3Q9NQ35 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
NRIP3Q9NQ35 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NRIP3Q9NQ35 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NRIP3Q9NQ35 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NRIP3Q9NQ35 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NRIP3Q9NQ35 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NRIP3Q9NQ35 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NRIP3Q9NQ35 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NRIP3Q9NQ35 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NRIP3Q9NQ35 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NRIP3Q9NQ35 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
NRIP3Q9NQ35 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NRIP3Q9NQ35 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NRIP3Q9NQ35 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
NRIP3Q9NQ35 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NRIP3Q9NQ35 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NRIP3Q9NQ35 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NRIP3Q9NQ35 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NRIP3Q9NQ35 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NRIP3Q9NQ35 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NRIP3Q9NQ35 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
NRIP3Q9NQ35 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NRIP3Q9NQ35 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NRIP3Q9NQ35 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NRIP3Q9NQ35 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NRIP3Q9NQ35 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NRIP3Q9NQ35 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NRIP3Q9NQ35 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NRIP3Q9NQ35 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NRIP3Q9NQ35 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NRIP3Q9NQ35 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NRIP3Q9NQ35 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NRIP3Q9NQ35 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NRIP3Q9NQ35 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NRIP3Q9NQ35 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NRIP3Q9NQ35 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
NRIP3Q9NQ35 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NRIP3Q9NQ35 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NRIP3Q9NQ35 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NRIP3Q9NQ35 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
NRIP3Q9NQ35 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NRIP3Q9NQ35 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NRIP3Q9NQ35 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NRIP3Q9NQ35 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NRIP3Q9NQ35 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NRIP3Q9NQ35 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NRIP3Q9NQ35 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NRIP3Q9NQ35 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NRIP3Q9NQ35 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NRIP3Q9NQ35 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NRIP3Q9NQ35 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NRIP3Q9NQ35 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NRIP3Q9NQ35 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NRIP3Q9NQ35 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NRIP3Q9NQ35 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NRIP3Q9NQ35 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NRIP3Q9NQ35 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms