Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPI8

FANCF, Fanconi anemia group F protein, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCFQ9NPI8 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
FANCFQ9NPI8 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
FANCFQ9NPI8 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
FANCFQ9NPI8 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
FANCFQ9NPI8 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
FANCFQ9NPI8 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
FANCFQ9NPI8 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
FANCFQ9NPI8 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
FANCFQ9NPI8 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
FANCFQ9NPI8 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
FANCFQ9NPI8 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
FANCFQ9NPI8 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
FANCFQ9NPI8 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
FANCFQ9NPI8 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
FANCFQ9NPI8 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
FANCFQ9NPI8 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
FANCFQ9NPI8 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
FANCFQ9NPI8 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
FANCFQ9NPI8 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
FANCFQ9NPI8 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
FANCFQ9NPI8 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
FANCFQ9NPI8 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
FANCFQ9NPI8 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
FANCFQ9NPI8 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
FANCFQ9NPI8 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
FANCFQ9NPI8 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
FANCFQ9NPI8 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
FANCFQ9NPI8 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
FANCFQ9NPI8 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
FANCFQ9NPI8 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
FANCFQ9NPI8 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
FANCFQ9NPI8 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
FANCFQ9NPI8 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
FANCFQ9NPI8 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
FANCFQ9NPI8 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
FANCFQ9NPI8 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
FANCFQ9NPI8 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
FANCFQ9NPI8 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
FANCFQ9NPI8 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
FANCFQ9NPI8 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
FANCFQ9NPI8 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
FANCFQ9NPI8 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
FANCFQ9NPI8 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
FANCFQ9NPI8 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
FANCFQ9NPI8 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
FANCFQ9NPI8 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
FANCFQ9NPI8 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
FANCFQ9NPI8 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
FANCFQ9NPI8 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
FANCFQ9NPI8 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
FANCFQ9NPI8 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
FANCFQ9NPI8 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
FANCFQ9NPI8 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
FANCFQ9NPI8 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
FANCFQ9NPI8 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
FANCFQ9NPI8 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
FANCFQ9NPI8 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
FANCFQ9NPI8 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
FANCFQ9NPI8 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
FANCFQ9NPI8 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
FANCFQ9NPI8 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
FANCFQ9NPI8 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
FANCFQ9NPI8 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
FANCFQ9NPI8 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
FANCFQ9NPI8 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
FANCFQ9NPI8 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
FANCFQ9NPI8 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
FANCFQ9NPI8 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
FANCFQ9NPI8 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
FANCFQ9NPI8 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
FANCFQ9NPI8 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
FANCFQ9NPI8 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
FANCFQ9NPI8 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
FANCFQ9NPI8 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
FANCFQ9NPI8 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
FANCFQ9NPI8 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
FANCFQ9NPI8 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
FANCFQ9NPI8 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
FANCFQ9NPI8 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
FANCFQ9NPI8 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
FANCFQ9NPI8 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
FANCFQ9NPI8 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
FANCFQ9NPI8 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
FANCFQ9NPI8 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
FANCFQ9NPI8 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
FANCFQ9NPI8 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
FANCFQ9NPI8 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
FANCFQ9NPI8 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
FANCFQ9NPI8 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
FANCFQ9NPI8 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
FANCFQ9NPI8 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
FANCFQ9NPI8 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC16.89■□□□□ 0.29
FANCFQ9NPI8 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.89■□□□□ 0.29
FANCFQ9NPI8 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
FANCFQ9NPI8 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
FANCFQ9NPI8 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
FANCFQ9NPI8 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
FANCFQ9NPI8 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
FANCFQ9NPI8 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
FANCFQ9NPI8 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
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