Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPH3

IL1RAP, Interleukin-1 receptor accessory protein, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IL1RAPQ9NPH3 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
IL1RAPQ9NPH3 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
IL1RAPQ9NPH3 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
IL1RAPQ9NPH3 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
IL1RAPQ9NPH3 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
IL1RAPQ9NPH3 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
IL1RAPQ9NPH3 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
IL1RAPQ9NPH3 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
IL1RAPQ9NPH3 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
IL1RAPQ9NPH3 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
IL1RAPQ9NPH3 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
IL1RAPQ9NPH3 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
IL1RAPQ9NPH3 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
IL1RAPQ9NPH3 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
IL1RAPQ9NPH3 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
IL1RAPQ9NPH3 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
IL1RAPQ9NPH3 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
IL1RAPQ9NPH3 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
IL1RAPQ9NPH3 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
IL1RAPQ9NPH3 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
IL1RAPQ9NPH3 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
IL1RAPQ9NPH3 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
IL1RAPQ9NPH3 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
IL1RAPQ9NPH3 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
IL1RAPQ9NPH3 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
IL1RAPQ9NPH3 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
IL1RAPQ9NPH3 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
IL1RAPQ9NPH3 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
IL1RAPQ9NPH3 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
IL1RAPQ9NPH3 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
IL1RAPQ9NPH3 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
IL1RAPQ9NPH3 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
IL1RAPQ9NPH3 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
IL1RAPQ9NPH3 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
IL1RAPQ9NPH3 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
IL1RAPQ9NPH3 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
IL1RAPQ9NPH3 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
IL1RAPQ9NPH3 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
IL1RAPQ9NPH3 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
IL1RAPQ9NPH3 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
IL1RAPQ9NPH3 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
IL1RAPQ9NPH3 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
IL1RAPQ9NPH3 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
IL1RAPQ9NPH3 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
IL1RAPQ9NPH3 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
IL1RAPQ9NPH3 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
IL1RAPQ9NPH3 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
IL1RAPQ9NPH3 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
IL1RAPQ9NPH3 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
IL1RAPQ9NPH3 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
IL1RAPQ9NPH3 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
IL1RAPQ9NPH3 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
IL1RAPQ9NPH3 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
IL1RAPQ9NPH3 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
IL1RAPQ9NPH3 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
IL1RAPQ9NPH3 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
IL1RAPQ9NPH3 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
IL1RAPQ9NPH3 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
IL1RAPQ9NPH3 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
IL1RAPQ9NPH3 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
IL1RAPQ9NPH3 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
IL1RAPQ9NPH3 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
IL1RAPQ9NPH3 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
IL1RAPQ9NPH3 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
IL1RAPQ9NPH3 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
IL1RAPQ9NPH3 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
IL1RAPQ9NPH3 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
IL1RAPQ9NPH3 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
IL1RAPQ9NPH3 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
IL1RAPQ9NPH3 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
IL1RAPQ9NPH3 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
IL1RAPQ9NPH3 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
IL1RAPQ9NPH3 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
IL1RAPQ9NPH3 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
IL1RAPQ9NPH3 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
IL1RAPQ9NPH3 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
IL1RAPQ9NPH3 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
IL1RAPQ9NPH3 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
IL1RAPQ9NPH3 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
IL1RAPQ9NPH3 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
IL1RAPQ9NPH3 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
IL1RAPQ9NPH3 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
IL1RAPQ9NPH3 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
IL1RAPQ9NPH3 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
IL1RAPQ9NPH3 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
IL1RAPQ9NPH3 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
IL1RAPQ9NPH3 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
IL1RAPQ9NPH3 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
IL1RAPQ9NPH3 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
IL1RAPQ9NPH3 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
IL1RAPQ9NPH3 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
IL1RAPQ9NPH3 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
IL1RAPQ9NPH3 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
IL1RAPQ9NPH3 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
IL1RAPQ9NPH3 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
IL1RAPQ9NPH3 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
IL1RAPQ9NPH3 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
IL1RAPQ9NPH3 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
IL1RAPQ9NPH3 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
IL1RAPQ9NPH3 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms