Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPG1

FZD3, Frizzled-3, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FZD3Q9NPG1 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FZD3Q9NPG1 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
FZD3Q9NPG1 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
FZD3Q9NPG1 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
FZD3Q9NPG1 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FZD3Q9NPG1 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FZD3Q9NPG1 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
FZD3Q9NPG1 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
FZD3Q9NPG1 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
FZD3Q9NPG1 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
FZD3Q9NPG1 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
FZD3Q9NPG1 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FZD3Q9NPG1 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
FZD3Q9NPG1 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FZD3Q9NPG1 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FZD3Q9NPG1 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FZD3Q9NPG1 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
FZD3Q9NPG1 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FZD3Q9NPG1 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
FZD3Q9NPG1 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FZD3Q9NPG1 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FZD3Q9NPG1 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FZD3Q9NPG1 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FZD3Q9NPG1 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FZD3Q9NPG1 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FZD3Q9NPG1 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FZD3Q9NPG1 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FZD3Q9NPG1 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FZD3Q9NPG1 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FZD3Q9NPG1 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FZD3Q9NPG1 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FZD3Q9NPG1 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FZD3Q9NPG1 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FZD3Q9NPG1 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FZD3Q9NPG1 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FZD3Q9NPG1 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FZD3Q9NPG1 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FZD3Q9NPG1 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FZD3Q9NPG1 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FZD3Q9NPG1 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FZD3Q9NPG1 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
FZD3Q9NPG1 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FZD3Q9NPG1 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FZD3Q9NPG1 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FZD3Q9NPG1 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FZD3Q9NPG1 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FZD3Q9NPG1 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FZD3Q9NPG1 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FZD3Q9NPG1 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FZD3Q9NPG1 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FZD3Q9NPG1 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FZD3Q9NPG1 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FZD3Q9NPG1 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FZD3Q9NPG1 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
FZD3Q9NPG1 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
FZD3Q9NPG1 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
FZD3Q9NPG1 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
FZD3Q9NPG1 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
FZD3Q9NPG1 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
FZD3Q9NPG1 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FZD3Q9NPG1 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FZD3Q9NPG1 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
FZD3Q9NPG1 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
FZD3Q9NPG1 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FZD3Q9NPG1 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FZD3Q9NPG1 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FZD3Q9NPG1 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FZD3Q9NPG1 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
FZD3Q9NPG1 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
FZD3Q9NPG1 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FZD3Q9NPG1 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
FZD3Q9NPG1 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
FZD3Q9NPG1 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
FZD3Q9NPG1 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
FZD3Q9NPG1 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
FZD3Q9NPG1 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FZD3Q9NPG1 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
FZD3Q9NPG1 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FZD3Q9NPG1 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
FZD3Q9NPG1 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FZD3Q9NPG1 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
FZD3Q9NPG1 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FZD3Q9NPG1 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
FZD3Q9NPG1 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
FZD3Q9NPG1 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
FZD3Q9NPG1 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
FZD3Q9NPG1 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
FZD3Q9NPG1 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
FZD3Q9NPG1 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
FZD3Q9NPG1 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
FZD3Q9NPG1 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
FZD3Q9NPG1 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
FZD3Q9NPG1 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
FZD3Q9NPG1 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
FZD3Q9NPG1 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
FZD3Q9NPG1 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
FZD3Q9NPG1 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
FZD3Q9NPG1 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
FZD3Q9NPG1 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
FZD3Q9NPG1 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms