Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPC4

A4GALT, Lactosylceramide 4-alpha-galactosyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A4GALTQ9NPC4 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
A4GALTQ9NPC4 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
A4GALTQ9NPC4 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
A4GALTQ9NPC4 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
A4GALTQ9NPC4 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
A4GALTQ9NPC4 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
A4GALTQ9NPC4 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
A4GALTQ9NPC4 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
A4GALTQ9NPC4 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
A4GALTQ9NPC4 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
A4GALTQ9NPC4 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
A4GALTQ9NPC4 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
A4GALTQ9NPC4 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
A4GALTQ9NPC4 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
A4GALTQ9NPC4 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
A4GALTQ9NPC4 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
A4GALTQ9NPC4 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
A4GALTQ9NPC4 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
A4GALTQ9NPC4 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
A4GALTQ9NPC4 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
A4GALTQ9NPC4 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
A4GALTQ9NPC4 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
A4GALTQ9NPC4 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
A4GALTQ9NPC4 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
A4GALTQ9NPC4 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
A4GALTQ9NPC4 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
A4GALTQ9NPC4 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
A4GALTQ9NPC4 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
A4GALTQ9NPC4 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
A4GALTQ9NPC4 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
A4GALTQ9NPC4 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
A4GALTQ9NPC4 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
A4GALTQ9NPC4 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
A4GALTQ9NPC4 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
A4GALTQ9NPC4 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
A4GALTQ9NPC4 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
A4GALTQ9NPC4 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
A4GALTQ9NPC4 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
A4GALTQ9NPC4 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
A4GALTQ9NPC4 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
A4GALTQ9NPC4 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
A4GALTQ9NPC4 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
A4GALTQ9NPC4 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
A4GALTQ9NPC4 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
A4GALTQ9NPC4 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
A4GALTQ9NPC4 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
A4GALTQ9NPC4 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
A4GALTQ9NPC4 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
A4GALTQ9NPC4 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
A4GALTQ9NPC4 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
A4GALTQ9NPC4 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
A4GALTQ9NPC4 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
A4GALTQ9NPC4 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
A4GALTQ9NPC4 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
A4GALTQ9NPC4 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
A4GALTQ9NPC4 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
A4GALTQ9NPC4 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
A4GALTQ9NPC4 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
A4GALTQ9NPC4 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
A4GALTQ9NPC4 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
A4GALTQ9NPC4 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
A4GALTQ9NPC4 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
A4GALTQ9NPC4 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
A4GALTQ9NPC4 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
A4GALTQ9NPC4 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
A4GALTQ9NPC4 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
A4GALTQ9NPC4 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
A4GALTQ9NPC4 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
A4GALTQ9NPC4 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
A4GALTQ9NPC4 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
A4GALTQ9NPC4 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
A4GALTQ9NPC4 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
A4GALTQ9NPC4 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
A4GALTQ9NPC4 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
A4GALTQ9NPC4 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
A4GALTQ9NPC4 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
A4GALTQ9NPC4 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
A4GALTQ9NPC4 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
A4GALTQ9NPC4 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
A4GALTQ9NPC4 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
A4GALTQ9NPC4 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
A4GALTQ9NPC4 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
A4GALTQ9NPC4 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
A4GALTQ9NPC4 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
A4GALTQ9NPC4 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
A4GALTQ9NPC4 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
A4GALTQ9NPC4 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
A4GALTQ9NPC4 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
A4GALTQ9NPC4 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
A4GALTQ9NPC4 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
A4GALTQ9NPC4 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
A4GALTQ9NPC4 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
A4GALTQ9NPC4 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
A4GALTQ9NPC4 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
A4GALTQ9NPC4 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
A4GALTQ9NPC4 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
A4GALTQ9NPC4 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
A4GALTQ9NPC4 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
A4GALTQ9NPC4 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
A4GALTQ9NPC4 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms