Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7N4

SCAF1, Splicing factor, arginine/serine-rich 19, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAF1Q9H7N4 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
SCAF1Q9H7N4 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SCAF1Q9H7N4 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SCAF1Q9H7N4 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SCAF1Q9H7N4 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SCAF1Q9H7N4 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SCAF1Q9H7N4 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SCAF1Q9H7N4 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SCAF1Q9H7N4 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SCAF1Q9H7N4 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SCAF1Q9H7N4 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
SCAF1Q9H7N4 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SCAF1Q9H7N4 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
SCAF1Q9H7N4 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SCAF1Q9H7N4 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SCAF1Q9H7N4 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SCAF1Q9H7N4 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SCAF1Q9H7N4 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SCAF1Q9H7N4 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SCAF1Q9H7N4 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SCAF1Q9H7N4 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SCAF1Q9H7N4 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SCAF1Q9H7N4 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SCAF1Q9H7N4 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SCAF1Q9H7N4 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SCAF1Q9H7N4 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
SCAF1Q9H7N4 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SCAF1Q9H7N4 LINC01670-203ENST00000624859 977 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SCAF1Q9H7N4 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SCAF1Q9H7N4 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SCAF1Q9H7N4 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SCAF1Q9H7N4 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SCAF1Q9H7N4 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SCAF1Q9H7N4 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SCAF1Q9H7N4 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SCAF1Q9H7N4 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SCAF1Q9H7N4 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SCAF1Q9H7N4 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SCAF1Q9H7N4 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SCAF1Q9H7N4 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SCAF1Q9H7N4 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SCAF1Q9H7N4 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SCAF1Q9H7N4 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SCAF1Q9H7N4 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SCAF1Q9H7N4 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SCAF1Q9H7N4 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SCAF1Q9H7N4 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SCAF1Q9H7N4 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SCAF1Q9H7N4 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SCAF1Q9H7N4 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SCAF1Q9H7N4 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SCAF1Q9H7N4 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SCAF1Q9H7N4 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SCAF1Q9H7N4 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SCAF1Q9H7N4 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SCAF1Q9H7N4 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SCAF1Q9H7N4 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
SCAF1Q9H7N4 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SCAF1Q9H7N4 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SCAF1Q9H7N4 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SCAF1Q9H7N4 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SCAF1Q9H7N4 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SCAF1Q9H7N4 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SCAF1Q9H7N4 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SCAF1Q9H7N4 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SCAF1Q9H7N4 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SCAF1Q9H7N4 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SCAF1Q9H7N4 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SCAF1Q9H7N4 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SCAF1Q9H7N4 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
SCAF1Q9H7N4 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SCAF1Q9H7N4 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SCAF1Q9H7N4 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
SCAF1Q9H7N4 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SCAF1Q9H7N4 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SCAF1Q9H7N4 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SCAF1Q9H7N4 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SCAF1Q9H7N4 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SCAF1Q9H7N4 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SCAF1Q9H7N4 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SCAF1Q9H7N4 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SCAF1Q9H7N4 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SCAF1Q9H7N4 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SCAF1Q9H7N4 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SCAF1Q9H7N4 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SCAF1Q9H7N4 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SCAF1Q9H7N4 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SCAF1Q9H7N4 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SCAF1Q9H7N4 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SCAF1Q9H7N4 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SCAF1Q9H7N4 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SCAF1Q9H7N4 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SCAF1Q9H7N4 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SCAF1Q9H7N4 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SCAF1Q9H7N4 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SCAF1Q9H7N4 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SCAF1Q9H7N4 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SCAF1Q9H7N4 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SCAF1Q9H7N4 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SCAF1Q9H7N4 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.3 ms