Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2J1

ARRDC1-AS1, Uncharacterized protein ARRDC1-AS1, humanhuman

Predictions only

Length 176 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARRDC1-AS1Q9H2J1 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ARRDC1-AS1Q9H2J1 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ARRDC1-AS1Q9H2J1 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ARRDC1-AS1Q9H2J1 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ARRDC1-AS1Q9H2J1 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ARRDC1-AS1Q9H2J1 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ARRDC1-AS1Q9H2J1 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ARRDC1-AS1Q9H2J1 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ARRDC1-AS1Q9H2J1 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ARRDC1-AS1Q9H2J1 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ARRDC1-AS1Q9H2J1 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ARRDC1-AS1Q9H2J1 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ARRDC1-AS1Q9H2J1 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
ARRDC1-AS1Q9H2J1 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ARRDC1-AS1Q9H2J1 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
ARRDC1-AS1Q9H2J1 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ARRDC1-AS1Q9H2J1 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
ARRDC1-AS1Q9H2J1 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
ARRDC1-AS1Q9H2J1 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ARRDC1-AS1Q9H2J1 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ARRDC1-AS1Q9H2J1 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ARRDC1-AS1Q9H2J1 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ARRDC1-AS1Q9H2J1 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ARRDC1-AS1Q9H2J1 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ARRDC1-AS1Q9H2J1 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ARRDC1-AS1Q9H2J1 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ARRDC1-AS1Q9H2J1 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ARRDC1-AS1Q9H2J1 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ARRDC1-AS1Q9H2J1 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ARRDC1-AS1Q9H2J1 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ARRDC1-AS1Q9H2J1 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ARRDC1-AS1Q9H2J1 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ARRDC1-AS1Q9H2J1 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ARRDC1-AS1Q9H2J1 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ARRDC1-AS1Q9H2J1 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ARRDC1-AS1Q9H2J1 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ARRDC1-AS1Q9H2J1 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ARRDC1-AS1Q9H2J1 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ARRDC1-AS1Q9H2J1 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ARRDC1-AS1Q9H2J1 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
ARRDC1-AS1Q9H2J1 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ARRDC1-AS1Q9H2J1 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ARRDC1-AS1Q9H2J1 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
ARRDC1-AS1Q9H2J1 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ARRDC1-AS1Q9H2J1 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ARRDC1-AS1Q9H2J1 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ARRDC1-AS1Q9H2J1 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ARRDC1-AS1Q9H2J1 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ARRDC1-AS1Q9H2J1 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ARRDC1-AS1Q9H2J1 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ARRDC1-AS1Q9H2J1 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ARRDC1-AS1Q9H2J1 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ARRDC1-AS1Q9H2J1 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ARRDC1-AS1Q9H2J1 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ARRDC1-AS1Q9H2J1 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ARRDC1-AS1Q9H2J1 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ARRDC1-AS1Q9H2J1 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ARRDC1-AS1Q9H2J1 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ARRDC1-AS1Q9H2J1 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ARRDC1-AS1Q9H2J1 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ARRDC1-AS1Q9H2J1 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ARRDC1-AS1Q9H2J1 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ARRDC1-AS1Q9H2J1 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ARRDC1-AS1Q9H2J1 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ARRDC1-AS1Q9H2J1 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ARRDC1-AS1Q9H2J1 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ARRDC1-AS1Q9H2J1 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ARRDC1-AS1Q9H2J1 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ARRDC1-AS1Q9H2J1 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
ARRDC1-AS1Q9H2J1 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ARRDC1-AS1Q9H2J1 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
ARRDC1-AS1Q9H2J1 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ARRDC1-AS1Q9H2J1 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ARRDC1-AS1Q9H2J1 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ARRDC1-AS1Q9H2J1 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
ARRDC1-AS1Q9H2J1 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ARRDC1-AS1Q9H2J1 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ARRDC1-AS1Q9H2J1 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ARRDC1-AS1Q9H2J1 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ARRDC1-AS1Q9H2J1 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ARRDC1-AS1Q9H2J1 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ARRDC1-AS1Q9H2J1 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ARRDC1-AS1Q9H2J1 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ARRDC1-AS1Q9H2J1 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ARRDC1-AS1Q9H2J1 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
ARRDC1-AS1Q9H2J1 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ARRDC1-AS1Q9H2J1 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ARRDC1-AS1Q9H2J1 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ARRDC1-AS1Q9H2J1 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ARRDC1-AS1Q9H2J1 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ARRDC1-AS1Q9H2J1 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ARRDC1-AS1Q9H2J1 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ARRDC1-AS1Q9H2J1 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ARRDC1-AS1Q9H2J1 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ARRDC1-AS1Q9H2J1 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ARRDC1-AS1Q9H2J1 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ARRDC1-AS1Q9H2J1 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ARRDC1-AS1Q9H2J1 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ARRDC1-AS1Q9H2J1 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ARRDC1-AS1Q9H2J1 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58 ms