Protein–RNA interactions for Protein: Q9C099

LRRCC1, Leucine-rich repeat and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRCC1Q9C099 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
LRRCC1Q9C099 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
LRRCC1Q9C099 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
LRRCC1Q9C099 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LRRCC1Q9C099 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
LRRCC1Q9C099 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
LRRCC1Q9C099 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LRRCC1Q9C099 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
LRRCC1Q9C099 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LRRCC1Q9C099 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
LRRCC1Q9C099 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LRRCC1Q9C099 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LRRCC1Q9C099 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
LRRCC1Q9C099 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LRRCC1Q9C099 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
LRRCC1Q9C099 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
LRRCC1Q9C099 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
LRRCC1Q9C099 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
LRRCC1Q9C099 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
LRRCC1Q9C099 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LRRCC1Q9C099 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LRRCC1Q9C099 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LRRCC1Q9C099 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LRRCC1Q9C099 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LRRCC1Q9C099 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LRRCC1Q9C099 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
LRRCC1Q9C099 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LRRCC1Q9C099 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LRRCC1Q9C099 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LRRCC1Q9C099 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LRRCC1Q9C099 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LRRCC1Q9C099 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LRRCC1Q9C099 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LRRCC1Q9C099 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LRRCC1Q9C099 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LRRCC1Q9C099 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LRRCC1Q9C099 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LRRCC1Q9C099 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LRRCC1Q9C099 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LRRCC1Q9C099 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LRRCC1Q9C099 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LRRCC1Q9C099 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LRRCC1Q9C099 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LRRCC1Q9C099 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LRRCC1Q9C099 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LRRCC1Q9C099 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LRRCC1Q9C099 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LRRCC1Q9C099 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LRRCC1Q9C099 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LRRCC1Q9C099 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LRRCC1Q9C099 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LRRCC1Q9C099 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LRRCC1Q9C099 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LRRCC1Q9C099 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LRRCC1Q9C099 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LRRCC1Q9C099 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LRRCC1Q9C099 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LRRCC1Q9C099 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
LRRCC1Q9C099 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LRRCC1Q9C099 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LRRCC1Q9C099 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
LRRCC1Q9C099 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
LRRCC1Q9C099 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
LRRCC1Q9C099 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LRRCC1Q9C099 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LRRCC1Q9C099 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LRRCC1Q9C099 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LRRCC1Q9C099 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LRRCC1Q9C099 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LRRCC1Q9C099 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LRRCC1Q9C099 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LRRCC1Q9C099 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LRRCC1Q9C099 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LRRCC1Q9C099 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LRRCC1Q9C099 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LRRCC1Q9C099 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LRRCC1Q9C099 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LRRCC1Q9C099 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LRRCC1Q9C099 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LRRCC1Q9C099 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
LRRCC1Q9C099 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LRRCC1Q9C099 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LRRCC1Q9C099 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LRRCC1Q9C099 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LRRCC1Q9C099 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LRRCC1Q9C099 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LRRCC1Q9C099 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LRRCC1Q9C099 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
LRRCC1Q9C099 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LRRCC1Q9C099 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LRRCC1Q9C099 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LRRCC1Q9C099 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LRRCC1Q9C099 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LRRCC1Q9C099 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LRRCC1Q9C099 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LRRCC1Q9C099 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LRRCC1Q9C099 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LRRCC1Q9C099 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LRRCC1Q9C099 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LRRCC1Q9C099 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms