Protein–RNA interactions for Protein: Q9C002

NMES1, Normal mucosa of esophagus-specific gene 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMES1Q9C002 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NMES1Q9C002 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NMES1Q9C002 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NMES1Q9C002 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NMES1Q9C002 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NMES1Q9C002 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NMES1Q9C002 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NMES1Q9C002 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NMES1Q9C002 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NMES1Q9C002 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NMES1Q9C002 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
NMES1Q9C002 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NMES1Q9C002 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NMES1Q9C002 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NMES1Q9C002 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NMES1Q9C002 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NMES1Q9C002 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NMES1Q9C002 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NMES1Q9C002 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NMES1Q9C002 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NMES1Q9C002 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NMES1Q9C002 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NMES1Q9C002 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NMES1Q9C002 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NMES1Q9C002 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NMES1Q9C002 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NMES1Q9C002 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NMES1Q9C002 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NMES1Q9C002 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NMES1Q9C002 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NMES1Q9C002 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NMES1Q9C002 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NMES1Q9C002 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NMES1Q9C002 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NMES1Q9C002 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NMES1Q9C002 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
NMES1Q9C002 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NMES1Q9C002 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NMES1Q9C002 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
NMES1Q9C002 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NMES1Q9C002 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NMES1Q9C002 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NMES1Q9C002 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NMES1Q9C002 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NMES1Q9C002 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NMES1Q9C002 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NMES1Q9C002 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NMES1Q9C002 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NMES1Q9C002 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NMES1Q9C002 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NMES1Q9C002 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NMES1Q9C002 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NMES1Q9C002 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NMES1Q9C002 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NMES1Q9C002 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NMES1Q9C002 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
NMES1Q9C002 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NMES1Q9C002 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NMES1Q9C002 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NMES1Q9C002 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NMES1Q9C002 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NMES1Q9C002 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
NMES1Q9C002 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NMES1Q9C002 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
NMES1Q9C002 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
NMES1Q9C002 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NMES1Q9C002 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NMES1Q9C002 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
NMES1Q9C002 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NMES1Q9C002 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NMES1Q9C002 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NMES1Q9C002 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NMES1Q9C002 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NMES1Q9C002 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NMES1Q9C002 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NMES1Q9C002 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NMES1Q9C002 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NMES1Q9C002 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NMES1Q9C002 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NMES1Q9C002 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NMES1Q9C002 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NMES1Q9C002 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NMES1Q9C002 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NMES1Q9C002 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NMES1Q9C002 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NMES1Q9C002 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NMES1Q9C002 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NMES1Q9C002 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
NMES1Q9C002 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NMES1Q9C002 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NMES1Q9C002 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NMES1Q9C002 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NMES1Q9C002 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NMES1Q9C002 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
NMES1Q9C002 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NMES1Q9C002 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
NMES1Q9C002 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NMES1Q9C002 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NMES1Q9C002 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NMES1Q9C002 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms