Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV2

TRIM54, Tripartite motif-containing protein 54, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM54Q9BYV2 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRIM54Q9BYV2 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRIM54Q9BYV2 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRIM54Q9BYV2 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
TRIM54Q9BYV2 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRIM54Q9BYV2 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRIM54Q9BYV2 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRIM54Q9BYV2 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRIM54Q9BYV2 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRIM54Q9BYV2 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRIM54Q9BYV2 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRIM54Q9BYV2 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRIM54Q9BYV2 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRIM54Q9BYV2 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRIM54Q9BYV2 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRIM54Q9BYV2 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRIM54Q9BYV2 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRIM54Q9BYV2 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRIM54Q9BYV2 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRIM54Q9BYV2 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRIM54Q9BYV2 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
TRIM54Q9BYV2 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRIM54Q9BYV2 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
TRIM54Q9BYV2 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRIM54Q9BYV2 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRIM54Q9BYV2 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRIM54Q9BYV2 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRIM54Q9BYV2 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRIM54Q9BYV2 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRIM54Q9BYV2 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRIM54Q9BYV2 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRIM54Q9BYV2 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRIM54Q9BYV2 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRIM54Q9BYV2 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRIM54Q9BYV2 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRIM54Q9BYV2 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRIM54Q9BYV2 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRIM54Q9BYV2 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
TRIM54Q9BYV2 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRIM54Q9BYV2 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRIM54Q9BYV2 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRIM54Q9BYV2 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
TRIM54Q9BYV2 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRIM54Q9BYV2 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRIM54Q9BYV2 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRIM54Q9BYV2 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRIM54Q9BYV2 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRIM54Q9BYV2 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRIM54Q9BYV2 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRIM54Q9BYV2 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRIM54Q9BYV2 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
TRIM54Q9BYV2 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRIM54Q9BYV2 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRIM54Q9BYV2 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRIM54Q9BYV2 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRIM54Q9BYV2 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRIM54Q9BYV2 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRIM54Q9BYV2 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRIM54Q9BYV2 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRIM54Q9BYV2 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRIM54Q9BYV2 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRIM54Q9BYV2 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRIM54Q9BYV2 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRIM54Q9BYV2 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRIM54Q9BYV2 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRIM54Q9BYV2 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRIM54Q9BYV2 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRIM54Q9BYV2 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRIM54Q9BYV2 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRIM54Q9BYV2 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRIM54Q9BYV2 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRIM54Q9BYV2 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRIM54Q9BYV2 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRIM54Q9BYV2 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRIM54Q9BYV2 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRIM54Q9BYV2 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRIM54Q9BYV2 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRIM54Q9BYV2 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRIM54Q9BYV2 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRIM54Q9BYV2 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRIM54Q9BYV2 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRIM54Q9BYV2 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRIM54Q9BYV2 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
TRIM54Q9BYV2 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRIM54Q9BYV2 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRIM54Q9BYV2 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRIM54Q9BYV2 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRIM54Q9BYV2 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRIM54Q9BYV2 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRIM54Q9BYV2 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRIM54Q9BYV2 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRIM54Q9BYV2 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRIM54Q9BYV2 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRIM54Q9BYV2 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRIM54Q9BYV2 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRIM54Q9BYV2 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRIM54Q9BYV2 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRIM54Q9BYV2 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRIM54Q9BYV2 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRIM54Q9BYV2 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms