Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW9

FANCD2, Fanconi anemia group D2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,451 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCD2Q9BXW9 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC31.51■■■□□ 2.63
FANCD2Q9BXW9 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC31.5■■■□□ 2.63
FANCD2Q9BXW9 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
FANCD2Q9BXW9 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
FANCD2Q9BXW9 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.5■■■□□ 2.63
FANCD2Q9BXW9 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
FANCD2Q9BXW9 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC31.5■■■□□ 2.63
FANCD2Q9BXW9 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC31.5■■■□□ 2.63
FANCD2Q9BXW9 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.5■■■□□ 2.63
FANCD2Q9BXW9 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
FANCD2Q9BXW9 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
FANCD2Q9BXW9 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
FANCD2Q9BXW9 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
FANCD2Q9BXW9 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC31.49■■■□□ 2.63
FANCD2Q9BXW9 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
FANCD2Q9BXW9 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.49■■■□□ 2.63
FANCD2Q9BXW9 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
FANCD2Q9BXW9 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
FANCD2Q9BXW9 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC31.49■■■□□ 2.63
FANCD2Q9BXW9 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC31.49■■■□□ 2.63
FANCD2Q9BXW9 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
FANCD2Q9BXW9 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC31.49■■■□□ 2.63
FANCD2Q9BXW9 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
FANCD2Q9BXW9 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC31.49■■■□□ 2.63
FANCD2Q9BXW9 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
FANCD2Q9BXW9 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
FANCD2Q9BXW9 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
FANCD2Q9BXW9 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC31.49■■■□□ 2.63
FANCD2Q9BXW9 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
FANCD2Q9BXW9 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.48■■■□□ 2.63
FANCD2Q9BXW9 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
FANCD2Q9BXW9 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
FANCD2Q9BXW9 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
FANCD2Q9BXW9 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC31.48■■■□□ 2.63
FANCD2Q9BXW9 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC31.48■■■□□ 2.63
FANCD2Q9BXW9 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
FANCD2Q9BXW9 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC31.48■■■□□ 2.63
FANCD2Q9BXW9 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC31.48■■■□□ 2.63
FANCD2Q9BXW9 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.48■■■□□ 2.63
FANCD2Q9BXW9 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
FANCD2Q9BXW9 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
FANCD2Q9BXW9 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
FANCD2Q9BXW9 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC31.48■■■□□ 2.63
FANCD2Q9BXW9 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC31.48■■■□□ 2.63
FANCD2Q9BXW9 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC31.48■■■□□ 2.63
FANCD2Q9BXW9 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.48■■■□□ 2.63
FANCD2Q9BXW9 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
FANCD2Q9BXW9 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC31.47■■■□□ 2.63
FANCD2Q9BXW9 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC31.47■■■□□ 2.63
FANCD2Q9BXW9 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC31.47■■■□□ 2.63
FANCD2Q9BXW9 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC31.47■■■□□ 2.63
FANCD2Q9BXW9 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.47■■■□□ 2.63
FANCD2Q9BXW9 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
FANCD2Q9BXW9 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
FANCD2Q9BXW9 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC31.47■■■□□ 2.63
FANCD2Q9BXW9 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
FANCD2Q9BXW9 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC31.47■■■□□ 2.63
FANCD2Q9BXW9 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
FANCD2Q9BXW9 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC31.46■■■□□ 2.63
FANCD2Q9BXW9 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC31.46■■■□□ 2.63
FANCD2Q9BXW9 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC31.46■■■□□ 2.63
FANCD2Q9BXW9 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC31.46■■■□□ 2.63
FANCD2Q9BXW9 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
FANCD2Q9BXW9 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
FANCD2Q9BXW9 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
FANCD2Q9BXW9 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC31.46■■■□□ 2.63
FANCD2Q9BXW9 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC31.46■■■□□ 2.63
FANCD2Q9BXW9 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC31.46■■■□□ 2.63
FANCD2Q9BXW9 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC31.46■■■□□ 2.63
FANCD2Q9BXW9 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
FANCD2Q9BXW9 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC31.46■■■□□ 2.63
FANCD2Q9BXW9 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
FANCD2Q9BXW9 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC31.46■■■□□ 2.63
FANCD2Q9BXW9 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC31.46■■■□□ 2.63
FANCD2Q9BXW9 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC31.46■■■□□ 2.63
FANCD2Q9BXW9 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC31.46■■■□□ 2.63
FANCD2Q9BXW9 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
FANCD2Q9BXW9 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
FANCD2Q9BXW9 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
FANCD2Q9BXW9 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC31.45■■■□□ 2.63
FANCD2Q9BXW9 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
FANCD2Q9BXW9 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC31.45■■■□□ 2.63
FANCD2Q9BXW9 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
FANCD2Q9BXW9 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.45■■■□□ 2.63
FANCD2Q9BXW9 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
FANCD2Q9BXW9 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC31.45■■■□□ 2.63
FANCD2Q9BXW9 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.45■■■□□ 2.62
FANCD2Q9BXW9 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.45■■■□□ 2.62
FANCD2Q9BXW9 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC31.45■■■□□ 2.62
FANCD2Q9BXW9 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC31.45■■■□□ 2.62
FANCD2Q9BXW9 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC31.45■■■□□ 2.62
FANCD2Q9BXW9 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC31.45■■■□□ 2.62
FANCD2Q9BXW9 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.62
FANCD2Q9BXW9 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC31.45■■■□□ 2.62
FANCD2Q9BXW9 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC31.45■■■□□ 2.62
FANCD2Q9BXW9 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC31.45■■■□□ 2.62
FANCD2Q9BXW9 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.44■■■□□ 2.62
FANCD2Q9BXW9 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.44■■■□□ 2.62
FANCD2Q9BXW9 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
FANCD2Q9BXW9 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC31.44■■■□□ 2.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms