Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW11

MXD3, Max dimerization protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MXD3Q9BW11 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MXD3Q9BW11 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MXD3Q9BW11 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MXD3Q9BW11 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MXD3Q9BW11 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MXD3Q9BW11 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MXD3Q9BW11 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MXD3Q9BW11 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MXD3Q9BW11 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MXD3Q9BW11 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MXD3Q9BW11 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MXD3Q9BW11 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MXD3Q9BW11 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MXD3Q9BW11 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MXD3Q9BW11 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MXD3Q9BW11 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MXD3Q9BW11 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MXD3Q9BW11 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MXD3Q9BW11 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MXD3Q9BW11 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MXD3Q9BW11 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MXD3Q9BW11 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MXD3Q9BW11 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MXD3Q9BW11 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MXD3Q9BW11 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MXD3Q9BW11 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MXD3Q9BW11 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MXD3Q9BW11 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MXD3Q9BW11 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MXD3Q9BW11 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MXD3Q9BW11 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MXD3Q9BW11 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MXD3Q9BW11 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MXD3Q9BW11 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MXD3Q9BW11 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MXD3Q9BW11 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MXD3Q9BW11 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MXD3Q9BW11 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MXD3Q9BW11 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MXD3Q9BW11 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MXD3Q9BW11 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MXD3Q9BW11 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MXD3Q9BW11 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MXD3Q9BW11 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MXD3Q9BW11 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MXD3Q9BW11 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
MXD3Q9BW11 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MXD3Q9BW11 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MXD3Q9BW11 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
MXD3Q9BW11 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MXD3Q9BW11 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MXD3Q9BW11 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MXD3Q9BW11 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MXD3Q9BW11 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MXD3Q9BW11 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
MXD3Q9BW11 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MXD3Q9BW11 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MXD3Q9BW11 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MXD3Q9BW11 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MXD3Q9BW11 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MXD3Q9BW11 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
MXD3Q9BW11 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MXD3Q9BW11 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MXD3Q9BW11 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MXD3Q9BW11 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MXD3Q9BW11 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MXD3Q9BW11 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MXD3Q9BW11 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MXD3Q9BW11 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MXD3Q9BW11 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MXD3Q9BW11 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MXD3Q9BW11 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
MXD3Q9BW11 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MXD3Q9BW11 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MXD3Q9BW11 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
MXD3Q9BW11 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MXD3Q9BW11 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MXD3Q9BW11 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
MXD3Q9BW11 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
MXD3Q9BW11 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MXD3Q9BW11 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
MXD3Q9BW11 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MXD3Q9BW11 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MXD3Q9BW11 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MXD3Q9BW11 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MXD3Q9BW11 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MXD3Q9BW11 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MXD3Q9BW11 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MXD3Q9BW11 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MXD3Q9BW11 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MXD3Q9BW11 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MXD3Q9BW11 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MXD3Q9BW11 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
MXD3Q9BW11 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
MXD3Q9BW11 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MXD3Q9BW11 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MXD3Q9BW11 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MXD3Q9BW11 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MXD3Q9BW11 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MXD3Q9BW11 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms