Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQI6

SLF1, SMC5-SMC6 complex localization factor protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,058 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLF1Q9BQI6 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLF1Q9BQI6 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLF1Q9BQI6 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLF1Q9BQI6 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLF1Q9BQI6 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
SLF1Q9BQI6 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLF1Q9BQI6 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLF1Q9BQI6 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLF1Q9BQI6 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLF1Q9BQI6 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLF1Q9BQI6 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLF1Q9BQI6 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLF1Q9BQI6 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLF1Q9BQI6 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLF1Q9BQI6 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLF1Q9BQI6 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLF1Q9BQI6 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLF1Q9BQI6 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
SLF1Q9BQI6 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLF1Q9BQI6 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLF1Q9BQI6 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
SLF1Q9BQI6 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
SLF1Q9BQI6 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLF1Q9BQI6 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLF1Q9BQI6 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLF1Q9BQI6 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLF1Q9BQI6 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
SLF1Q9BQI6 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLF1Q9BQI6 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
SLF1Q9BQI6 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLF1Q9BQI6 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLF1Q9BQI6 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLF1Q9BQI6 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLF1Q9BQI6 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLF1Q9BQI6 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLF1Q9BQI6 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLF1Q9BQI6 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLF1Q9BQI6 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLF1Q9BQI6 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLF1Q9BQI6 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLF1Q9BQI6 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLF1Q9BQI6 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLF1Q9BQI6 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLF1Q9BQI6 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLF1Q9BQI6 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLF1Q9BQI6 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLF1Q9BQI6 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLF1Q9BQI6 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLF1Q9BQI6 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLF1Q9BQI6 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLF1Q9BQI6 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLF1Q9BQI6 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
SLF1Q9BQI6 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
SLF1Q9BQI6 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLF1Q9BQI6 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLF1Q9BQI6 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
SLF1Q9BQI6 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLF1Q9BQI6 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLF1Q9BQI6 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLF1Q9BQI6 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLF1Q9BQI6 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLF1Q9BQI6 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLF1Q9BQI6 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLF1Q9BQI6 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLF1Q9BQI6 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLF1Q9BQI6 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLF1Q9BQI6 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLF1Q9BQI6 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLF1Q9BQI6 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLF1Q9BQI6 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLF1Q9BQI6 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLF1Q9BQI6 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLF1Q9BQI6 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
SLF1Q9BQI6 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLF1Q9BQI6 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLF1Q9BQI6 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLF1Q9BQI6 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLF1Q9BQI6 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLF1Q9BQI6 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLF1Q9BQI6 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLF1Q9BQI6 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLF1Q9BQI6 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLF1Q9BQI6 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLF1Q9BQI6 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLF1Q9BQI6 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLF1Q9BQI6 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLF1Q9BQI6 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLF1Q9BQI6 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLF1Q9BQI6 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLF1Q9BQI6 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLF1Q9BQI6 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLF1Q9BQI6 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLF1Q9BQI6 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLF1Q9BQI6 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLF1Q9BQI6 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLF1Q9BQI6 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLF1Q9BQI6 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLF1Q9BQI6 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLF1Q9BQI6 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLF1Q9BQI6 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.8 ms