Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ16

SPOCK3, Testican-3, humanhuman

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Length 436 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCK3Q9BQ16 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPOCK3Q9BQ16 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPOCK3Q9BQ16 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPOCK3Q9BQ16 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPOCK3Q9BQ16 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPOCK3Q9BQ16 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPOCK3Q9BQ16 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPOCK3Q9BQ16 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SPOCK3Q9BQ16 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPOCK3Q9BQ16 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPOCK3Q9BQ16 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPOCK3Q9BQ16 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPOCK3Q9BQ16 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SPOCK3Q9BQ16 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPOCK3Q9BQ16 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPOCK3Q9BQ16 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SPOCK3Q9BQ16 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPOCK3Q9BQ16 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SPOCK3Q9BQ16 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPOCK3Q9BQ16 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPOCK3Q9BQ16 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPOCK3Q9BQ16 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SPOCK3Q9BQ16 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SPOCK3Q9BQ16 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SPOCK3Q9BQ16 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SPOCK3Q9BQ16 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SPOCK3Q9BQ16 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SPOCK3Q9BQ16 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
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SPOCK3Q9BQ16 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SPOCK3Q9BQ16 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SPOCK3Q9BQ16 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SPOCK3Q9BQ16 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SPOCK3Q9BQ16 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SPOCK3Q9BQ16 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SPOCK3Q9BQ16 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SPOCK3Q9BQ16 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SPOCK3Q9BQ16 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SPOCK3Q9BQ16 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SPOCK3Q9BQ16 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SPOCK3Q9BQ16 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SPOCK3Q9BQ16 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SPOCK3Q9BQ16 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SPOCK3Q9BQ16 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
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SPOCK3Q9BQ16 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
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SPOCK3Q9BQ16 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
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SPOCK3Q9BQ16 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPOCK3Q9BQ16 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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SPOCK3Q9BQ16 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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SPOCK3Q9BQ16 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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SPOCK3Q9BQ16 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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SPOCK3Q9BQ16 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPOCK3Q9BQ16 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPOCK3Q9BQ16 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPOCK3Q9BQ16 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPOCK3Q9BQ16 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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SPOCK3Q9BQ16 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPOCK3Q9BQ16 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPOCK3Q9BQ16 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPOCK3Q9BQ16 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPOCK3Q9BQ16 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPOCK3Q9BQ16 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPOCK3Q9BQ16 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPOCK3Q9BQ16 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SPOCK3Q9BQ16 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPOCK3Q9BQ16 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPOCK3Q9BQ16 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPOCK3Q9BQ16 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SPOCK3Q9BQ16 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPOCK3Q9BQ16 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
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