Protein–RNA interactions for Protein: Q99999

GAL3ST1, Galactosylceramide sulfotransferase, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GAL3ST1Q99999 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GAL3ST1Q99999 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GAL3ST1Q99999 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GAL3ST1Q99999 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GAL3ST1Q99999 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GAL3ST1Q99999 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GAL3ST1Q99999 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GAL3ST1Q99999 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GAL3ST1Q99999 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GAL3ST1Q99999 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GAL3ST1Q99999 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GAL3ST1Q99999 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GAL3ST1Q99999 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
GAL3ST1Q99999 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GAL3ST1Q99999 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GAL3ST1Q99999 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GAL3ST1Q99999 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GAL3ST1Q99999 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GAL3ST1Q99999 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GAL3ST1Q99999 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GAL3ST1Q99999 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GAL3ST1Q99999 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GAL3ST1Q99999 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GAL3ST1Q99999 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GAL3ST1Q99999 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GAL3ST1Q99999 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GAL3ST1Q99999 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GAL3ST1Q99999 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
GAL3ST1Q99999 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GAL3ST1Q99999 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GAL3ST1Q99999 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GAL3ST1Q99999 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GAL3ST1Q99999 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GAL3ST1Q99999 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GAL3ST1Q99999 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GAL3ST1Q99999 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GAL3ST1Q99999 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GAL3ST1Q99999 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GAL3ST1Q99999 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GAL3ST1Q99999 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
GAL3ST1Q99999 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GAL3ST1Q99999 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GAL3ST1Q99999 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GAL3ST1Q99999 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GAL3ST1Q99999 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GAL3ST1Q99999 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GAL3ST1Q99999 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GAL3ST1Q99999 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
GAL3ST1Q99999 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
GAL3ST1Q99999 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GAL3ST1Q99999 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GAL3ST1Q99999 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GAL3ST1Q99999 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GAL3ST1Q99999 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GAL3ST1Q99999 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GAL3ST1Q99999 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GAL3ST1Q99999 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GAL3ST1Q99999 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GAL3ST1Q99999 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GAL3ST1Q99999 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GAL3ST1Q99999 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GAL3ST1Q99999 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GAL3ST1Q99999 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GAL3ST1Q99999 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GAL3ST1Q99999 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GAL3ST1Q99999 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GAL3ST1Q99999 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GAL3ST1Q99999 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GAL3ST1Q99999 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GAL3ST1Q99999 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GAL3ST1Q99999 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GAL3ST1Q99999 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GAL3ST1Q99999 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GAL3ST1Q99999 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GAL3ST1Q99999 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GAL3ST1Q99999 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GAL3ST1Q99999 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GAL3ST1Q99999 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GAL3ST1Q99999 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GAL3ST1Q99999 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GAL3ST1Q99999 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GAL3ST1Q99999 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GAL3ST1Q99999 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GAL3ST1Q99999 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GAL3ST1Q99999 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GAL3ST1Q99999 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GAL3ST1Q99999 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
GAL3ST1Q99999 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GAL3ST1Q99999 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GAL3ST1Q99999 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GAL3ST1Q99999 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GAL3ST1Q99999 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GAL3ST1Q99999 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GAL3ST1Q99999 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GAL3ST1Q99999 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GAL3ST1Q99999 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GAL3ST1Q99999 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GAL3ST1Q99999 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GAL3ST1Q99999 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GAL3ST1Q99999 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms