Protein–RNA interactions for Protein: Q99836

MYD88, Myeloid differentiation primary response protein MyD88, humanhuman

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYD88Q99836 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
MYD88Q99836 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MYD88Q99836 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MYD88Q99836 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MYD88Q99836 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MYD88Q99836 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MYD88Q99836 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MYD88Q99836 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MYD88Q99836 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MYD88Q99836 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MYD88Q99836 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MYD88Q99836 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MYD88Q99836 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MYD88Q99836 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MYD88Q99836 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MYD88Q99836 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MYD88Q99836 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MYD88Q99836 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MYD88Q99836 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MYD88Q99836 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MYD88Q99836 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MYD88Q99836 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MYD88Q99836 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MYD88Q99836 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MYD88Q99836 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MYD88Q99836 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
MYD88Q99836 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MYD88Q99836 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MYD88Q99836 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MYD88Q99836 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
MYD88Q99836 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MYD88Q99836 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MYD88Q99836 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MYD88Q99836 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MYD88Q99836 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MYD88Q99836 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MYD88Q99836 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MYD88Q99836 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MYD88Q99836 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
MYD88Q99836 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
MYD88Q99836 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MYD88Q99836 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
MYD88Q99836 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
MYD88Q99836 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MYD88Q99836 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MYD88Q99836 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MYD88Q99836 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MYD88Q99836 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MYD88Q99836 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MYD88Q99836 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MYD88Q99836 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MYD88Q99836 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MYD88Q99836 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MYD88Q99836 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MYD88Q99836 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MYD88Q99836 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MYD88Q99836 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MYD88Q99836 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MYD88Q99836 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MYD88Q99836 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MYD88Q99836 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MYD88Q99836 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
MYD88Q99836 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MYD88Q99836 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MYD88Q99836 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MYD88Q99836 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MYD88Q99836 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MYD88Q99836 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MYD88Q99836 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
MYD88Q99836 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MYD88Q99836 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MYD88Q99836 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MYD88Q99836 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MYD88Q99836 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
MYD88Q99836 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MYD88Q99836 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MYD88Q99836 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
MYD88Q99836 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MYD88Q99836 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MYD88Q99836 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MYD88Q99836 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MYD88Q99836 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MYD88Q99836 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MYD88Q99836 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MYD88Q99836 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MYD88Q99836 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MYD88Q99836 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MYD88Q99836 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MYD88Q99836 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MYD88Q99836 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MYD88Q99836 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MYD88Q99836 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MYD88Q99836 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MYD88Q99836 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MYD88Q99836 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MYD88Q99836 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MYD88Q99836 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MYD88Q99836 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MYD88Q99836 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MYD88Q99836 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.2 ms