Protein–RNA interactions for Protein: Q99666

RGPD5, RANBP2-like and GRIP domain-containing protein 5/6, humanhuman

Predictions only

Length 1,765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD5Q99666 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RGPD5Q99666 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
RGPD5Q99666 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
RGPD5Q99666 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
RGPD5Q99666 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
RGPD5Q99666 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
RGPD5Q99666 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RGPD5Q99666 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RGPD5Q99666 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RGPD5Q99666 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RGPD5Q99666 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RGPD5Q99666 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RGPD5Q99666 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
RGPD5Q99666 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RGPD5Q99666 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RGPD5Q99666 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RGPD5Q99666 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RGPD5Q99666 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RGPD5Q99666 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RGPD5Q99666 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RGPD5Q99666 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RGPD5Q99666 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RGPD5Q99666 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RGPD5Q99666 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RGPD5Q99666 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RGPD5Q99666 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RGPD5Q99666 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RGPD5Q99666 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RGPD5Q99666 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RGPD5Q99666 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RGPD5Q99666 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RGPD5Q99666 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RGPD5Q99666 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RGPD5Q99666 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RGPD5Q99666 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RGPD5Q99666 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RGPD5Q99666 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RGPD5Q99666 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RGPD5Q99666 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RGPD5Q99666 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RGPD5Q99666 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RGPD5Q99666 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RGPD5Q99666 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RGPD5Q99666 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RGPD5Q99666 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RGPD5Q99666 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RGPD5Q99666 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RGPD5Q99666 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RGPD5Q99666 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RGPD5Q99666 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RGPD5Q99666 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RGPD5Q99666 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RGPD5Q99666 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RGPD5Q99666 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RGPD5Q99666 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RGPD5Q99666 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RGPD5Q99666 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RGPD5Q99666 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RGPD5Q99666 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RGPD5Q99666 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RGPD5Q99666 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RGPD5Q99666 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RGPD5Q99666 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RGPD5Q99666 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RGPD5Q99666 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RGPD5Q99666 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RGPD5Q99666 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RGPD5Q99666 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RGPD5Q99666 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RGPD5Q99666 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RGPD5Q99666 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RGPD5Q99666 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
RGPD5Q99666 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
RGPD5Q99666 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
RGPD5Q99666 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RGPD5Q99666 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RGPD5Q99666 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RGPD5Q99666 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RGPD5Q99666 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RGPD5Q99666 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RGPD5Q99666 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RGPD5Q99666 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
RGPD5Q99666 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RGPD5Q99666 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RGPD5Q99666 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RGPD5Q99666 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
RGPD5Q99666 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
RGPD5Q99666 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RGPD5Q99666 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RGPD5Q99666 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RGPD5Q99666 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RGPD5Q99666 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RGPD5Q99666 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RGPD5Q99666 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RGPD5Q99666 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RGPD5Q99666 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
RGPD5Q99666 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RGPD5Q99666 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RGPD5Q99666 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RGPD5Q99666 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms