Protein–RNA interactions for Protein: Q99523

SORT1, Sortilin, humanhuman

Predictions only

Length 831 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SORT1Q99523 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SORT1Q99523 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SORT1Q99523 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SORT1Q99523 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SORT1Q99523 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SORT1Q99523 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SORT1Q99523 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SORT1Q99523 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SORT1Q99523 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SORT1Q99523 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SORT1Q99523 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SORT1Q99523 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SORT1Q99523 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SORT1Q99523 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SORT1Q99523 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SORT1Q99523 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SORT1Q99523 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SORT1Q99523 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SORT1Q99523 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SORT1Q99523 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SORT1Q99523 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
SORT1Q99523 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SORT1Q99523 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SORT1Q99523 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
SORT1Q99523 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SORT1Q99523 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SORT1Q99523 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SORT1Q99523 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SORT1Q99523 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SORT1Q99523 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SORT1Q99523 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SORT1Q99523 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SORT1Q99523 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
SORT1Q99523 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SORT1Q99523 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SORT1Q99523 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SORT1Q99523 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SORT1Q99523 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SORT1Q99523 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SORT1Q99523 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SORT1Q99523 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SORT1Q99523 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
SORT1Q99523 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SORT1Q99523 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SORT1Q99523 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SORT1Q99523 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SORT1Q99523 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SORT1Q99523 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SORT1Q99523 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SORT1Q99523 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SORT1Q99523 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SORT1Q99523 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SORT1Q99523 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SORT1Q99523 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SORT1Q99523 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SORT1Q99523 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SORT1Q99523 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
SORT1Q99523 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SORT1Q99523 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SORT1Q99523 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SORT1Q99523 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SORT1Q99523 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SORT1Q99523 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
SORT1Q99523 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SORT1Q99523 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SORT1Q99523 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SORT1Q99523 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SORT1Q99523 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SORT1Q99523 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SORT1Q99523 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SORT1Q99523 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SORT1Q99523 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SORT1Q99523 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
SORT1Q99523 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SORT1Q99523 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SORT1Q99523 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SORT1Q99523 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SORT1Q99523 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SORT1Q99523 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SORT1Q99523 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SORT1Q99523 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SORT1Q99523 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SORT1Q99523 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SORT1Q99523 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SORT1Q99523 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SORT1Q99523 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SORT1Q99523 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SORT1Q99523 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SORT1Q99523 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SORT1Q99523 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SORT1Q99523 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SORT1Q99523 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SORT1Q99523 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SORT1Q99523 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SORT1Q99523 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SORT1Q99523 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SORT1Q99523 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SORT1Q99523 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SORT1Q99523 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SORT1Q99523 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms