Protein–RNA interactions for Protein: Q96S38

RPS6KC1, Ribosomal protein S6 kinase delta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KC1Q96S38 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RPS6KC1Q96S38 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RPS6KC1Q96S38 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RPS6KC1Q96S38 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RPS6KC1Q96S38 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RPS6KC1Q96S38 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RPS6KC1Q96S38 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RPS6KC1Q96S38 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RPS6KC1Q96S38 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RPS6KC1Q96S38 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RPS6KC1Q96S38 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RPS6KC1Q96S38 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RPS6KC1Q96S38 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RPS6KC1Q96S38 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RPS6KC1Q96S38 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RPS6KC1Q96S38 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RPS6KC1Q96S38 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RPS6KC1Q96S38 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RPS6KC1Q96S38 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RPS6KC1Q96S38 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RPS6KC1Q96S38 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RPS6KC1Q96S38 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RPS6KC1Q96S38 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RPS6KC1Q96S38 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RPS6KC1Q96S38 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RPS6KC1Q96S38 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RPS6KC1Q96S38 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RPS6KC1Q96S38 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RPS6KC1Q96S38 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
RPS6KC1Q96S38 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RPS6KC1Q96S38 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RPS6KC1Q96S38 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
RPS6KC1Q96S38 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RPS6KC1Q96S38 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RPS6KC1Q96S38 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RPS6KC1Q96S38 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RPS6KC1Q96S38 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RPS6KC1Q96S38 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RPS6KC1Q96S38 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RPS6KC1Q96S38 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RPS6KC1Q96S38 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RPS6KC1Q96S38 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RPS6KC1Q96S38 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
RPS6KC1Q96S38 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
RPS6KC1Q96S38 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RPS6KC1Q96S38 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
RPS6KC1Q96S38 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
RPS6KC1Q96S38 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
RPS6KC1Q96S38 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
RPS6KC1Q96S38 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
RPS6KC1Q96S38 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RPS6KC1Q96S38 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
RPS6KC1Q96S38 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
RPS6KC1Q96S38 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
RPS6KC1Q96S38 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.33■□□□□ 0.85
RPS6KC1Q96S38 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RPS6KC1Q96S38 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
RPS6KC1Q96S38 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
RPS6KC1Q96S38 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
RPS6KC1Q96S38 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
RPS6KC1Q96S38 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
RPS6KC1Q96S38 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
RPS6KC1Q96S38 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
RPS6KC1Q96S38 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
RPS6KC1Q96S38 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
RPS6KC1Q96S38 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
RPS6KC1Q96S38 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
RPS6KC1Q96S38 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RPS6KC1Q96S38 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RPS6KC1Q96S38 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RPS6KC1Q96S38 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RPS6KC1Q96S38 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RPS6KC1Q96S38 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
RPS6KC1Q96S38 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RPS6KC1Q96S38 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RPS6KC1Q96S38 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RPS6KC1Q96S38 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RPS6KC1Q96S38 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RPS6KC1Q96S38 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RPS6KC1Q96S38 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
RPS6KC1Q96S38 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RPS6KC1Q96S38 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RPS6KC1Q96S38 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RPS6KC1Q96S38 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
RPS6KC1Q96S38 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RPS6KC1Q96S38 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RPS6KC1Q96S38 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RPS6KC1Q96S38 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RPS6KC1Q96S38 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RPS6KC1Q96S38 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RPS6KC1Q96S38 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RPS6KC1Q96S38 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RPS6KC1Q96S38 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RPS6KC1Q96S38 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RPS6KC1Q96S38 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RPS6KC1Q96S38 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RPS6KC1Q96S38 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RPS6KC1Q96S38 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RPS6KC1Q96S38 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RPS6KC1Q96S38 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms