Protein–RNA interactions for Protein: Q96RK0

CIC, Protein capicua homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,608 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CICQ96RK0 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CICQ96RK0 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CICQ96RK0 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CICQ96RK0 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CICQ96RK0 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CICQ96RK0 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CICQ96RK0 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CICQ96RK0 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CICQ96RK0 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CICQ96RK0 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CICQ96RK0 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CICQ96RK0 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CICQ96RK0 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CICQ96RK0 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CICQ96RK0 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CICQ96RK0 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CICQ96RK0 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CICQ96RK0 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CICQ96RK0 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CICQ96RK0 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CICQ96RK0 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CICQ96RK0 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CICQ96RK0 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CICQ96RK0 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CICQ96RK0 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CICQ96RK0 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CICQ96RK0 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CICQ96RK0 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CICQ96RK0 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CICQ96RK0 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CICQ96RK0 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CICQ96RK0 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CICQ96RK0 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CICQ96RK0 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CICQ96RK0 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CICQ96RK0 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CICQ96RK0 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CICQ96RK0 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CICQ96RK0 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CICQ96RK0 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CICQ96RK0 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CICQ96RK0 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CICQ96RK0 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CICQ96RK0 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CICQ96RK0 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CICQ96RK0 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CICQ96RK0 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CICQ96RK0 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CICQ96RK0 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CICQ96RK0 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CICQ96RK0 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CICQ96RK0 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CICQ96RK0 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CICQ96RK0 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CICQ96RK0 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CICQ96RK0 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CICQ96RK0 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CICQ96RK0 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CICQ96RK0 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CICQ96RK0 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CICQ96RK0 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CICQ96RK0 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CICQ96RK0 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CICQ96RK0 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CICQ96RK0 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CICQ96RK0 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CICQ96RK0 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CICQ96RK0 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CICQ96RK0 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CICQ96RK0 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CICQ96RK0 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CICQ96RK0 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CICQ96RK0 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CICQ96RK0 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CICQ96RK0 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CICQ96RK0 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CICQ96RK0 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CICQ96RK0 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CICQ96RK0 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CICQ96RK0 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CICQ96RK0 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CICQ96RK0 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CICQ96RK0 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CICQ96RK0 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CICQ96RK0 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CICQ96RK0 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CICQ96RK0 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CICQ96RK0 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CICQ96RK0 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CICQ96RK0 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CICQ96RK0 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CICQ96RK0 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CICQ96RK0 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CICQ96RK0 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CICQ96RK0 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CICQ96RK0 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CICQ96RK0 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CICQ96RK0 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CICQ96RK0 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CICQ96RK0 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms