Protein–RNA interactions for Protein: Q96QS3

ARX, Homeobox protein ARX, humanhuman

Predictions only

Length 562 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARXQ96QS3 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ARXQ96QS3 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ARXQ96QS3 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ARXQ96QS3 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ARXQ96QS3 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ARXQ96QS3 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ARXQ96QS3 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ARXQ96QS3 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ARXQ96QS3 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ARXQ96QS3 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ARXQ96QS3 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ARXQ96QS3 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ARXQ96QS3 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ARXQ96QS3 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ARXQ96QS3 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ARXQ96QS3 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ARXQ96QS3 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
ARXQ96QS3 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
ARXQ96QS3 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
ARXQ96QS3 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
ARXQ96QS3 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
ARXQ96QS3 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
ARXQ96QS3 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
ARXQ96QS3 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
ARXQ96QS3 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
ARXQ96QS3 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
ARXQ96QS3 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ARXQ96QS3 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ARXQ96QS3 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ARXQ96QS3 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ARXQ96QS3 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ARXQ96QS3 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ARXQ96QS3 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
ARXQ96QS3 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ARXQ96QS3 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ARXQ96QS3 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ARXQ96QS3 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ARXQ96QS3 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ARXQ96QS3 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ARXQ96QS3 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ARXQ96QS3 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ARXQ96QS3 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ARXQ96QS3 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ARXQ96QS3 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ARXQ96QS3 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ARXQ96QS3 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ARXQ96QS3 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ARXQ96QS3 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ARXQ96QS3 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ARXQ96QS3 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ARXQ96QS3 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ARXQ96QS3 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ARXQ96QS3 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ARXQ96QS3 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ARXQ96QS3 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ARXQ96QS3 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ARXQ96QS3 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ARXQ96QS3 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
ARXQ96QS3 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
ARXQ96QS3 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ARXQ96QS3 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ARXQ96QS3 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ARXQ96QS3 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
ARXQ96QS3 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ARXQ96QS3 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ARXQ96QS3 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ARXQ96QS3 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
ARXQ96QS3 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
ARXQ96QS3 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ARXQ96QS3 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ARXQ96QS3 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ARXQ96QS3 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
ARXQ96QS3 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ARXQ96QS3 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ARXQ96QS3 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ARXQ96QS3 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ARXQ96QS3 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ARXQ96QS3 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ARXQ96QS3 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ARXQ96QS3 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
ARXQ96QS3 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ARXQ96QS3 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ARXQ96QS3 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ARXQ96QS3 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ARXQ96QS3 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ARXQ96QS3 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ARXQ96QS3 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ARXQ96QS3 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
ARXQ96QS3 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ARXQ96QS3 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
ARXQ96QS3 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ARXQ96QS3 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
ARXQ96QS3 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ARXQ96QS3 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ARXQ96QS3 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ARXQ96QS3 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ARXQ96QS3 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ARXQ96QS3 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ARXQ96QS3 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ARXQ96QS3 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms