Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q05

TRAPPC9, Trafficking protein particle complex subunit 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC9Q96Q05 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
TRAPPC9Q96Q05 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
TRAPPC9Q96Q05 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRAPPC9Q96Q05 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRAPPC9Q96Q05 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRAPPC9Q96Q05 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRAPPC9Q96Q05 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRAPPC9Q96Q05 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRAPPC9Q96Q05 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRAPPC9Q96Q05 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRAPPC9Q96Q05 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
TRAPPC9Q96Q05 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRAPPC9Q96Q05 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRAPPC9Q96Q05 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRAPPC9Q96Q05 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
TRAPPC9Q96Q05 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRAPPC9Q96Q05 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRAPPC9Q96Q05 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRAPPC9Q96Q05 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRAPPC9Q96Q05 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRAPPC9Q96Q05 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRAPPC9Q96Q05 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRAPPC9Q96Q05 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRAPPC9Q96Q05 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRAPPC9Q96Q05 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRAPPC9Q96Q05 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRAPPC9Q96Q05 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRAPPC9Q96Q05 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRAPPC9Q96Q05 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRAPPC9Q96Q05 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRAPPC9Q96Q05 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
TRAPPC9Q96Q05 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRAPPC9Q96Q05 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRAPPC9Q96Q05 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRAPPC9Q96Q05 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRAPPC9Q96Q05 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRAPPC9Q96Q05 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRAPPC9Q96Q05 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRAPPC9Q96Q05 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRAPPC9Q96Q05 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRAPPC9Q96Q05 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRAPPC9Q96Q05 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRAPPC9Q96Q05 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRAPPC9Q96Q05 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRAPPC9Q96Q05 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRAPPC9Q96Q05 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRAPPC9Q96Q05 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRAPPC9Q96Q05 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRAPPC9Q96Q05 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRAPPC9Q96Q05 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRAPPC9Q96Q05 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRAPPC9Q96Q05 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRAPPC9Q96Q05 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRAPPC9Q96Q05 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRAPPC9Q96Q05 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRAPPC9Q96Q05 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRAPPC9Q96Q05 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
TRAPPC9Q96Q05 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRAPPC9Q96Q05 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRAPPC9Q96Q05 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRAPPC9Q96Q05 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRAPPC9Q96Q05 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRAPPC9Q96Q05 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRAPPC9Q96Q05 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRAPPC9Q96Q05 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRAPPC9Q96Q05 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRAPPC9Q96Q05 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRAPPC9Q96Q05 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRAPPC9Q96Q05 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRAPPC9Q96Q05 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRAPPC9Q96Q05 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRAPPC9Q96Q05 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRAPPC9Q96Q05 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRAPPC9Q96Q05 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRAPPC9Q96Q05 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRAPPC9Q96Q05 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRAPPC9Q96Q05 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRAPPC9Q96Q05 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRAPPC9Q96Q05 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRAPPC9Q96Q05 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRAPPC9Q96Q05 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRAPPC9Q96Q05 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
TRAPPC9Q96Q05 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRAPPC9Q96Q05 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRAPPC9Q96Q05 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRAPPC9Q96Q05 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRAPPC9Q96Q05 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRAPPC9Q96Q05 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRAPPC9Q96Q05 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRAPPC9Q96Q05 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRAPPC9Q96Q05 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRAPPC9Q96Q05 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRAPPC9Q96Q05 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRAPPC9Q96Q05 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRAPPC9Q96Q05 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRAPPC9Q96Q05 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRAPPC9Q96Q05 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRAPPC9Q96Q05 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRAPPC9Q96Q05 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRAPPC9Q96Q05 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms