Protein–RNA interactions for Protein: Q96PV0

SYNGAP1, Ras/Rap GTPase-activating protein SynGAP, humanhuman

Predictions only

Length 1,343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNGAP1Q96PV0 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SYNGAP1Q96PV0 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SYNGAP1Q96PV0 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SYNGAP1Q96PV0 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SYNGAP1Q96PV0 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SYNGAP1Q96PV0 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SYNGAP1Q96PV0 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SYNGAP1Q96PV0 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
SYNGAP1Q96PV0 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SYNGAP1Q96PV0 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
SYNGAP1Q96PV0 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SYNGAP1Q96PV0 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SYNGAP1Q96PV0 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SYNGAP1Q96PV0 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SYNGAP1Q96PV0 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SYNGAP1Q96PV0 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SYNGAP1Q96PV0 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SYNGAP1Q96PV0 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SYNGAP1Q96PV0 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SYNGAP1Q96PV0 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
SYNGAP1Q96PV0 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
SYNGAP1Q96PV0 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SYNGAP1Q96PV0 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SYNGAP1Q96PV0 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SYNGAP1Q96PV0 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
SYNGAP1Q96PV0 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SYNGAP1Q96PV0 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
SYNGAP1Q96PV0 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SYNGAP1Q96PV0 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SYNGAP1Q96PV0 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
SYNGAP1Q96PV0 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SYNGAP1Q96PV0 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SYNGAP1Q96PV0 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
SYNGAP1Q96PV0 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SYNGAP1Q96PV0 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SYNGAP1Q96PV0 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SYNGAP1Q96PV0 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SYNGAP1Q96PV0 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SYNGAP1Q96PV0 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
SYNGAP1Q96PV0 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SYNGAP1Q96PV0 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SYNGAP1Q96PV0 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SYNGAP1Q96PV0 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SYNGAP1Q96PV0 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SYNGAP1Q96PV0 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SYNGAP1Q96PV0 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SYNGAP1Q96PV0 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SYNGAP1Q96PV0 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SYNGAP1Q96PV0 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SYNGAP1Q96PV0 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SYNGAP1Q96PV0 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SYNGAP1Q96PV0 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SYNGAP1Q96PV0 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SYNGAP1Q96PV0 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SYNGAP1Q96PV0 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SYNGAP1Q96PV0 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
SYNGAP1Q96PV0 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SYNGAP1Q96PV0 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SYNGAP1Q96PV0 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SYNGAP1Q96PV0 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SYNGAP1Q96PV0 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SYNGAP1Q96PV0 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SYNGAP1Q96PV0 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SYNGAP1Q96PV0 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SYNGAP1Q96PV0 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SYNGAP1Q96PV0 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SYNGAP1Q96PV0 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SYNGAP1Q96PV0 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SYNGAP1Q96PV0 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SYNGAP1Q96PV0 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SYNGAP1Q96PV0 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SYNGAP1Q96PV0 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SYNGAP1Q96PV0 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SYNGAP1Q96PV0 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
SYNGAP1Q96PV0 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SYNGAP1Q96PV0 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SYNGAP1Q96PV0 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SYNGAP1Q96PV0 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SYNGAP1Q96PV0 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SYNGAP1Q96PV0 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SYNGAP1Q96PV0 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SYNGAP1Q96PV0 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SYNGAP1Q96PV0 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SYNGAP1Q96PV0 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SYNGAP1Q96PV0 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SYNGAP1Q96PV0 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SYNGAP1Q96PV0 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SYNGAP1Q96PV0 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SYNGAP1Q96PV0 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SYNGAP1Q96PV0 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SYNGAP1Q96PV0 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SYNGAP1Q96PV0 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SYNGAP1Q96PV0 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SYNGAP1Q96PV0 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
SYNGAP1Q96PV0 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SYNGAP1Q96PV0 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SYNGAP1Q96PV0 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SYNGAP1Q96PV0 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
SYNGAP1Q96PV0 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SYNGAP1Q96PV0 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms