Protein–RNA interactions for Protein: Q96M27

PRRC1, Protein PRRC1, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRC1Q96M27 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PRRC1Q96M27 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PRRC1Q96M27 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PRRC1Q96M27 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PRRC1Q96M27 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PRRC1Q96M27 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PRRC1Q96M27 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PRRC1Q96M27 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
PRRC1Q96M27 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
PRRC1Q96M27 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PRRC1Q96M27 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PRRC1Q96M27 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PRRC1Q96M27 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PRRC1Q96M27 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PRRC1Q96M27 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PRRC1Q96M27 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PRRC1Q96M27 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PRRC1Q96M27 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PRRC1Q96M27 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PRRC1Q96M27 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PRRC1Q96M27 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PRRC1Q96M27 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PRRC1Q96M27 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PRRC1Q96M27 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PRRC1Q96M27 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PRRC1Q96M27 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PRRC1Q96M27 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PRRC1Q96M27 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PRRC1Q96M27 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PRRC1Q96M27 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PRRC1Q96M27 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PRRC1Q96M27 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PRRC1Q96M27 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PRRC1Q96M27 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PRRC1Q96M27 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PRRC1Q96M27 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PRRC1Q96M27 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PRRC1Q96M27 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
PRRC1Q96M27 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PRRC1Q96M27 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
PRRC1Q96M27 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
PRRC1Q96M27 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PRRC1Q96M27 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
PRRC1Q96M27 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PRRC1Q96M27 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PRRC1Q96M27 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PRRC1Q96M27 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PRRC1Q96M27 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PRRC1Q96M27 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PRRC1Q96M27 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PRRC1Q96M27 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PRRC1Q96M27 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PRRC1Q96M27 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PRRC1Q96M27 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PRRC1Q96M27 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PRRC1Q96M27 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
PRRC1Q96M27 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PRRC1Q96M27 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PRRC1Q96M27 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PRRC1Q96M27 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PRRC1Q96M27 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PRRC1Q96M27 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PRRC1Q96M27 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PRRC1Q96M27 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PRRC1Q96M27 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PRRC1Q96M27 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PRRC1Q96M27 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
PRRC1Q96M27 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PRRC1Q96M27 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PRRC1Q96M27 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PRRC1Q96M27 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PRRC1Q96M27 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PRRC1Q96M27 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PRRC1Q96M27 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PRRC1Q96M27 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PRRC1Q96M27 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PRRC1Q96M27 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PRRC1Q96M27 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PRRC1Q96M27 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PRRC1Q96M27 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PRRC1Q96M27 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PRRC1Q96M27 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PRRC1Q96M27 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PRRC1Q96M27 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PRRC1Q96M27 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PRRC1Q96M27 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PRRC1Q96M27 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PRRC1Q96M27 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PRRC1Q96M27 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PRRC1Q96M27 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PRRC1Q96M27 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PRRC1Q96M27 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PRRC1Q96M27 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PRRC1Q96M27 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PRRC1Q96M27 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PRRC1Q96M27 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
PRRC1Q96M27 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PRRC1Q96M27 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PRRC1Q96M27 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PRRC1Q96M27 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.3 ms