Protein–RNA interactions for Protein: Q96M20

CNBD2, Cyclic nucleotide-binding domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 576 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNBD2Q96M20 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CNBD2Q96M20 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CNBD2Q96M20 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CNBD2Q96M20 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CNBD2Q96M20 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CNBD2Q96M20 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CNBD2Q96M20 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CNBD2Q96M20 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CNBD2Q96M20 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CNBD2Q96M20 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CNBD2Q96M20 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CNBD2Q96M20 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CNBD2Q96M20 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CNBD2Q96M20 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CNBD2Q96M20 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CNBD2Q96M20 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CNBD2Q96M20 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CNBD2Q96M20 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CNBD2Q96M20 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CNBD2Q96M20 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CNBD2Q96M20 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CNBD2Q96M20 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CNBD2Q96M20 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CNBD2Q96M20 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CNBD2Q96M20 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CNBD2Q96M20 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CNBD2Q96M20 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CNBD2Q96M20 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CNBD2Q96M20 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CNBD2Q96M20 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CNBD2Q96M20 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CNBD2Q96M20 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CNBD2Q96M20 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CNBD2Q96M20 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CNBD2Q96M20 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CNBD2Q96M20 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CNBD2Q96M20 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CNBD2Q96M20 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CNBD2Q96M20 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CNBD2Q96M20 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CNBD2Q96M20 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CNBD2Q96M20 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CNBD2Q96M20 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CNBD2Q96M20 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CNBD2Q96M20 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CNBD2Q96M20 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CNBD2Q96M20 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CNBD2Q96M20 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CNBD2Q96M20 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CNBD2Q96M20 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CNBD2Q96M20 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CNBD2Q96M20 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CNBD2Q96M20 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CNBD2Q96M20 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CNBD2Q96M20 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CNBD2Q96M20 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CNBD2Q96M20 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CNBD2Q96M20 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CNBD2Q96M20 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CNBD2Q96M20 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CNBD2Q96M20 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CNBD2Q96M20 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CNBD2Q96M20 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CNBD2Q96M20 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CNBD2Q96M20 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CNBD2Q96M20 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CNBD2Q96M20 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CNBD2Q96M20 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CNBD2Q96M20 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CNBD2Q96M20 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CNBD2Q96M20 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CNBD2Q96M20 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CNBD2Q96M20 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CNBD2Q96M20 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CNBD2Q96M20 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CNBD2Q96M20 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CNBD2Q96M20 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CNBD2Q96M20 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CNBD2Q96M20 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CNBD2Q96M20 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CNBD2Q96M20 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CNBD2Q96M20 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CNBD2Q96M20 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CNBD2Q96M20 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CNBD2Q96M20 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CNBD2Q96M20 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CNBD2Q96M20 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CNBD2Q96M20 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CNBD2Q96M20 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CNBD2Q96M20 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CNBD2Q96M20 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CNBD2Q96M20 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CNBD2Q96M20 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CNBD2Q96M20 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CNBD2Q96M20 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CNBD2Q96M20 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CNBD2Q96M20 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CNBD2Q96M20 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CNBD2Q96M20 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CNBD2Q96M20 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms