Protein–RNA interactions for Protein: Q96KF2

PRAC1, Small nuclear protein PRAC1, humanhuman

Predictions only

Length 57 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAC1Q96KF2 NOTCH4-201ENST00000375023 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
PRAC1Q96KF2 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC9.04□□□□□ -0.96
PRAC1Q96KF2 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
PRAC1Q96KF2 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.04□□□□□ -0.96
PRAC1Q96KF2 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.03□□□□□ -0.96
PRAC1Q96KF2 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
PRAC1Q96KF2 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.03□□□□□ -0.96
PRAC1Q96KF2 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.03□□□□□ -0.96
PRAC1Q96KF2 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
PRAC1Q96KF2 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
PRAC1Q96KF2 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
PRAC1Q96KF2 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC9.03□□□□□ -0.96
PRAC1Q96KF2 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
PRAC1Q96KF2 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
PRAC1Q96KF2 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
PRAC1Q96KF2 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
PRAC1Q96KF2 MLX-202ENST00000346833 2334 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
PRAC1Q96KF2 SPOCK3-210ENST00000506886 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.03□□□□□ -0.96
PRAC1Q96KF2 SPOCK3-218ENST00000511531 2908 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.03□□□□□ -0.96
PRAC1Q96KF2 SH3KBP1-205ENST00000397821 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
PRAC1Q96KF2 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
PRAC1Q96KF2 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
PRAC1Q96KF2 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
PRAC1Q96KF2 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC9.03□□□□□ -0.96
PRAC1Q96KF2 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC9.03□□□□□ -0.96
PRAC1Q96KF2 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
PRAC1Q96KF2 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
PRAC1Q96KF2 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.03□□□□□ -0.96
PRAC1Q96KF2 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.03□□□□□ -0.96
PRAC1Q96KF2 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.03□□□□□ -0.96
PRAC1Q96KF2 FZD5-201ENST00000295417 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
PRAC1Q96KF2 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC9.03□□□□□ -0.96
PRAC1Q96KF2 RCAN3-207ENST00000538532 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
PRAC1Q96KF2 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
PRAC1Q96KF2 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC9.03□□□□□ -0.96
PRAC1Q96KF2 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
PRAC1Q96KF2 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
PRAC1Q96KF2 AMIGO2-201ENST00000266581 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
PRAC1Q96KF2 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
PRAC1Q96KF2 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
PRAC1Q96KF2 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
PRAC1Q96KF2 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
PRAC1Q96KF2 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
PRAC1Q96KF2 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
PRAC1Q96KF2 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
PRAC1Q96KF2 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC9.03□□□□□ -0.96
PRAC1Q96KF2 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.03□□□□□ -0.96
PRAC1Q96KF2 FBXO41-201ENST00000295133 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
PRAC1Q96KF2 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.03□□□□□ -0.96
PRAC1Q96KF2 ELP1-201ENST00000374647 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
PRAC1Q96KF2 C15orf59-204ENST00000569673 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.02□□□□□ -0.96
PRAC1Q96KF2 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.96
PRAC1Q96KF2 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.96
PRAC1Q96KF2 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.96
PRAC1Q96KF2 ABCA2-201ENST00000265662 8154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.02□□□□□ -0.96
PRAC1Q96KF2 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC9.02□□□□□ -0.96
PRAC1Q96KF2 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC9.02□□□□□ -0.96
PRAC1Q96KF2 ZNF596-201ENST00000308811 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.96
PRAC1Q96KF2 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.96
PRAC1Q96KF2 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.96
PRAC1Q96KF2 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC9.02□□□□□ -0.96
PRAC1Q96KF2 SYT9-201ENST00000318881 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
PRAC1Q96KF2 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.02□□□□□ -0.97
PRAC1Q96KF2 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
PRAC1Q96KF2 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC9.02□□□□□ -0.97
PRAC1Q96KF2 SFMBT2-203ENST00000379713 2402 ntTSL 2 BASIC9.02□□□□□ -0.97
PRAC1Q96KF2 SFRP1-202ENST00000379845 3873 ntTSL 2 BASIC9.02□□□□□ -0.97
PRAC1Q96KF2 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC9.02□□□□□ -0.97
PRAC1Q96KF2 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC9.02□□□□□ -0.97
PRAC1Q96KF2 ZBP1-201ENST00000371173 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
PRAC1Q96KF2 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC9.02□□□□□ -0.97
PRAC1Q96KF2 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
PRAC1Q96KF2 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
PRAC1Q96KF2 LGALSL-201ENST00000238875 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
PRAC1Q96KF2 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
PRAC1Q96KF2 GPN1-201ENST00000264718 2496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
PRAC1Q96KF2 AL031728.1-201ENST00000449034 2479 ntTSL 3 BASIC9.02□□□□□ -0.97
PRAC1Q96KF2 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC9.02□□□□□ -0.97
PRAC1Q96KF2 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
PRAC1Q96KF2 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.02□□□□□ -0.97
PRAC1Q96KF2 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
PRAC1Q96KF2 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
PRAC1Q96KF2 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.02□□□□□ -0.97
PRAC1Q96KF2 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
PRAC1Q96KF2 LINC00926-202ENST00000502027 2141 ntTSL 2 BASIC9.02□□□□□ -0.97
PRAC1Q96KF2 AKNA-204ENST00000374075 5038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
PRAC1Q96KF2 PCDHB3-201ENST00000231130 3355 ntAPPRIS P1 BASIC9.02□□□□□ -0.97
PRAC1Q96KF2 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
PRAC1Q96KF2 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
PRAC1Q96KF2 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
PRAC1Q96KF2 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC9.02□□□□□ -0.97
PRAC1Q96KF2 ADAMTS7P1-201ENST00000613213 4793 ntBASIC9.02□□□□□ -0.97
PRAC1Q96KF2 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
PRAC1Q96KF2 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC9.02□□□□□ -0.97
PRAC1Q96KF2 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
PRAC1Q96KF2 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
PRAC1Q96KF2 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.02□□□□□ -0.97
PRAC1Q96KF2 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.02□□□□□ -0.97
PRAC1Q96KF2 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
PRAC1Q96KF2 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.02□□□□□ -0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms