Protein–RNA interactions for Protein: Q96K76

USP47, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 47, humanhuman

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Length 1,375 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP47Q96K76 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
USP47Q96K76 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
USP47Q96K76 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
USP47Q96K76 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
USP47Q96K76 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
USP47Q96K76 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
USP47Q96K76 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
USP47Q96K76 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
USP47Q96K76 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
USP47Q96K76 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
USP47Q96K76 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
USP47Q96K76 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
USP47Q96K76 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
USP47Q96K76 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
USP47Q96K76 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
USP47Q96K76 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
USP47Q96K76 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
USP47Q96K76 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
USP47Q96K76 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
USP47Q96K76 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
USP47Q96K76 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
USP47Q96K76 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
USP47Q96K76 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
USP47Q96K76 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
USP47Q96K76 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
USP47Q96K76 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
USP47Q96K76 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
USP47Q96K76 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
USP47Q96K76 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
USP47Q96K76 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
USP47Q96K76 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
USP47Q96K76 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
USP47Q96K76 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
USP47Q96K76 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
USP47Q96K76 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
USP47Q96K76 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
USP47Q96K76 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
USP47Q96K76 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
USP47Q96K76 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
USP47Q96K76 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC25.94■■□□□ 1.74
USP47Q96K76 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
USP47Q96K76 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
USP47Q96K76 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
USP47Q96K76 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
USP47Q96K76 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
USP47Q96K76 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
USP47Q96K76 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
USP47Q96K76 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
USP47Q96K76 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
USP47Q96K76 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
USP47Q96K76 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
USP47Q96K76 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
USP47Q96K76 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
USP47Q96K76 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
USP47Q96K76 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
USP47Q96K76 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
USP47Q96K76 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
USP47Q96K76 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
USP47Q96K76 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
USP47Q96K76 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
USP47Q96K76 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
USP47Q96K76 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
USP47Q96K76 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
USP47Q96K76 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
USP47Q96K76 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
USP47Q96K76 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
USP47Q96K76 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
USP47Q96K76 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
USP47Q96K76 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
USP47Q96K76 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
USP47Q96K76 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC25.92■■□□□ 1.74
USP47Q96K76 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
USP47Q96K76 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
USP47Q96K76 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
USP47Q96K76 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
USP47Q96K76 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
USP47Q96K76 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
USP47Q96K76 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
USP47Q96K76 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
USP47Q96K76 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
USP47Q96K76 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
USP47Q96K76 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
USP47Q96K76 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
USP47Q96K76 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
USP47Q96K76 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
USP47Q96K76 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
USP47Q96K76 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
USP47Q96K76 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
USP47Q96K76 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
USP47Q96K76 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
USP47Q96K76 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
USP47Q96K76 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
USP47Q96K76 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
USP47Q96K76 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
USP47Q96K76 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
USP47Q96K76 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
USP47Q96K76 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
USP47Q96K76 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
USP47Q96K76 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
USP47Q96K76 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
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