Protein–RNA interactions for Protein: Q96GP6

SCARF2, Scavenger receptor class F member 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 870 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARF2Q96GP6 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SCARF2Q96GP6 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SCARF2Q96GP6 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SCARF2Q96GP6 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SCARF2Q96GP6 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SCARF2Q96GP6 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SCARF2Q96GP6 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SCARF2Q96GP6 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
SCARF2Q96GP6 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SCARF2Q96GP6 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SCARF2Q96GP6 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SCARF2Q96GP6 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SCARF2Q96GP6 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SCARF2Q96GP6 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SCARF2Q96GP6 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SCARF2Q96GP6 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SCARF2Q96GP6 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SCARF2Q96GP6 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SCARF2Q96GP6 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SCARF2Q96GP6 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SCARF2Q96GP6 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SCARF2Q96GP6 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SCARF2Q96GP6 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SCARF2Q96GP6 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SCARF2Q96GP6 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SCARF2Q96GP6 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SCARF2Q96GP6 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SCARF2Q96GP6 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SCARF2Q96GP6 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SCARF2Q96GP6 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SCARF2Q96GP6 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SCARF2Q96GP6 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SCARF2Q96GP6 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SCARF2Q96GP6 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SCARF2Q96GP6 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SCARF2Q96GP6 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SCARF2Q96GP6 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SCARF2Q96GP6 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SCARF2Q96GP6 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SCARF2Q96GP6 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SCARF2Q96GP6 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SCARF2Q96GP6 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SCARF2Q96GP6 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SCARF2Q96GP6 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SCARF2Q96GP6 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SCARF2Q96GP6 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SCARF2Q96GP6 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SCARF2Q96GP6 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SCARF2Q96GP6 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SCARF2Q96GP6 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SCARF2Q96GP6 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SCARF2Q96GP6 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SCARF2Q96GP6 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SCARF2Q96GP6 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SCARF2Q96GP6 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SCARF2Q96GP6 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SCARF2Q96GP6 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
SCARF2Q96GP6 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SCARF2Q96GP6 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
SCARF2Q96GP6 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SCARF2Q96GP6 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SCARF2Q96GP6 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
SCARF2Q96GP6 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SCARF2Q96GP6 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SCARF2Q96GP6 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SCARF2Q96GP6 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SCARF2Q96GP6 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SCARF2Q96GP6 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SCARF2Q96GP6 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SCARF2Q96GP6 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SCARF2Q96GP6 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SCARF2Q96GP6 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SCARF2Q96GP6 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SCARF2Q96GP6 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SCARF2Q96GP6 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SCARF2Q96GP6 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SCARF2Q96GP6 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SCARF2Q96GP6 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SCARF2Q96GP6 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SCARF2Q96GP6 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SCARF2Q96GP6 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SCARF2Q96GP6 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SCARF2Q96GP6 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SCARF2Q96GP6 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SCARF2Q96GP6 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SCARF2Q96GP6 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SCARF2Q96GP6 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SCARF2Q96GP6 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SCARF2Q96GP6 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SCARF2Q96GP6 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SCARF2Q96GP6 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SCARF2Q96GP6 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SCARF2Q96GP6 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SCARF2Q96GP6 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SCARF2Q96GP6 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SCARF2Q96GP6 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SCARF2Q96GP6 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SCARF2Q96GP6 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SCARF2Q96GP6 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SCARF2Q96GP6 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms