Protein–RNA interactions for Protein: Q96ES7

SGF29, SAGA-associated factor 29, humanhuman

Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGF29Q96ES7 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SGF29Q96ES7 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SGF29Q96ES7 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SGF29Q96ES7 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SGF29Q96ES7 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SGF29Q96ES7 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SGF29Q96ES7 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SGF29Q96ES7 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SGF29Q96ES7 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SGF29Q96ES7 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SGF29Q96ES7 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SGF29Q96ES7 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SGF29Q96ES7 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SGF29Q96ES7 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SGF29Q96ES7 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
SGF29Q96ES7 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SGF29Q96ES7 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SGF29Q96ES7 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SGF29Q96ES7 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SGF29Q96ES7 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SGF29Q96ES7 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SGF29Q96ES7 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SGF29Q96ES7 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SGF29Q96ES7 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SGF29Q96ES7 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
SGF29Q96ES7 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SGF29Q96ES7 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SGF29Q96ES7 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SGF29Q96ES7 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SGF29Q96ES7 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SGF29Q96ES7 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
SGF29Q96ES7 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SGF29Q96ES7 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
SGF29Q96ES7 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SGF29Q96ES7 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
SGF29Q96ES7 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SGF29Q96ES7 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SGF29Q96ES7 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SGF29Q96ES7 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SGF29Q96ES7 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SGF29Q96ES7 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SGF29Q96ES7 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
SGF29Q96ES7 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SGF29Q96ES7 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SGF29Q96ES7 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SGF29Q96ES7 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SGF29Q96ES7 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SGF29Q96ES7 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SGF29Q96ES7 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SGF29Q96ES7 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SGF29Q96ES7 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SGF29Q96ES7 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SGF29Q96ES7 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SGF29Q96ES7 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SGF29Q96ES7 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SGF29Q96ES7 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SGF29Q96ES7 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SGF29Q96ES7 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SGF29Q96ES7 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SGF29Q96ES7 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SGF29Q96ES7 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
SGF29Q96ES7 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
SGF29Q96ES7 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
SGF29Q96ES7 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
SGF29Q96ES7 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.59
SGF29Q96ES7 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC18.77■□□□□ 0.59
SGF29Q96ES7 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
SGF29Q96ES7 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
SGF29Q96ES7 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
SGF29Q96ES7 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
SGF29Q96ES7 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SGF29Q96ES7 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SGF29Q96ES7 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SGF29Q96ES7 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SGF29Q96ES7 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SGF29Q96ES7 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SGF29Q96ES7 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SGF29Q96ES7 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SGF29Q96ES7 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SGF29Q96ES7 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SGF29Q96ES7 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SGF29Q96ES7 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SGF29Q96ES7 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
SGF29Q96ES7 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SGF29Q96ES7 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SGF29Q96ES7 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SGF29Q96ES7 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SGF29Q96ES7 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SGF29Q96ES7 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SGF29Q96ES7 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SGF29Q96ES7 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SGF29Q96ES7 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SGF29Q96ES7 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SGF29Q96ES7 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SGF29Q96ES7 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SGF29Q96ES7 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
SGF29Q96ES7 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SGF29Q96ES7 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SGF29Q96ES7 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SGF29Q96ES7 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71 ms